RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 NCR2O95944 276 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 CKS2P33552 79 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 BAGE3Q86Y29 109 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 PRELID3AQ96N28 172 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 AP1S3Q96PC3 154 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 M0QY20 66 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 FABP4P15090 132 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 HTN1P15515 57 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 LGALS9BQ3B8N2 356 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 CHCHD7Q9BUK0 85 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-214ENST00000530727 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 SYCNQ0VAF6 134 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 PYY3Q5JQD4 70 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 Q6Q795 121 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 Q8N8P6 123 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 OR10D4PQ8NGN7 298 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 C20orf78Q9BR46 151 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 C2orf88Q9BSF0 95 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM126AQ9H061 195 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GX51 115 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 A8MWV9 139 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZTI0 123 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 SPANXCQ9NY87 97 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 CELA1Q9UNI1 258 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 A8MU10 97 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 DLEU1O43261 78 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R17O96001 155 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-53P01767 116 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM6P0DI80 62 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 AKR1D1P51857 326 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 PMCHL1Q16048 86 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 RRN3P1Q2M238 152 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 SCXQ7RTU7 201 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 B9D2Q9BPU9 175 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM2Q9BVW6 85 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 K7EMI3 77 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 MGPP08493 103 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 C3orf79P0CE67 100 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 DEFB135Q30KP9 77 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 Q8NAQ8 132 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 CARD19Q96LW7 228 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 NIT2Q9NQR4 276 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 HBDP02042 147 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 P0DMU3 169 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 FAM231AP0DMU4 169 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 FAM231CP0DMU5 169 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 FCER1GP30273 86 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 TOMM6Q96B49 74 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 C12orf57Q99622 126 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 ST20Q9HBF5 79 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 STAB2Q8WWQ8 2551 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 IGLL5B9A064 214 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 K7EIL1 84 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 LEPROTL1O95214 131 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00694P0DN24 101 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 MIFP14174 115 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF56Q15929 161 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 DAND5Q8N907 189 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 RMI2Q96E14 147 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM223A0PJW6 202 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-214ENST00000530727 IGIPA6NJ69 53 aa2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms