RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TSTA3-208ENST00000528920 PET117Q6UWS5 81 aa9.35□□□□□ -0.91
TSTA3-208ENST00000528920 Q6ZRU5 148 aa9.35□□□□□ -0.91
TSTA3-208ENST00000528920 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TSTA3-208ENST00000528920 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.34□□□□□ -0.91
TSTA3-208ENST00000528920 F8WDY8 70 aa9.34□□□□□ -0.91
TSTA3-208ENST00000528920 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.34□□□□□ -0.91
TSTA3-208ENST00000528920 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.34□□□□□ -0.91
TSTA3-208ENST00000528920 SCGB1D1O95968 90 aa9.33□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 CHTF8P0CG12 524 aa9.33□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 KIAA0087Q14695 138 aa9.33□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.32□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 LINC01545Q5VT33 79 aa9.32□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.32□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 A0A096LNI7 61 aa9.31□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.31□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 C20orf202A1L168 122 aa9.31□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 FAM229AH3BQW9 127 aa9.31□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 NDUFA1O15239 70 aa9.31□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 RNF151Q2KHN1 245 aa9.31□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 Q5VSD8 79 aa9.31□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.31□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 H0Y8G0 127 aa9.3□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.3□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.3□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 FAT1Q14517 4588 aa9.3□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 A0A087WYN8 130 aa9.29□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.29□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.29□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 IGLC3P0DOY3 106 aa9.29□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 ODF1Q14990 250 aa9.29□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 C10orf25Q5T742 122 aa9.29□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.29□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 DPH3Q96FX2 82 aa9.29□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.28□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 MAJINQ3KP22 176 aa9.28□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 Q8IZM0 81 aa9.28□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 C12orf57Q99622 126 aa9.28□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.28□□□□□ -0.92
TSTA3-208ENST00000528920 PRSS2P07478 247 aa9.27□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.27□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.27□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.27□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.27□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 PTTG1IPP53801 180 aa9.26□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 GAGE2BQ13066 116 aa9.26□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 C2orf82Q6UX34 121 aa9.26□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.26□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.25□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 F8VRH5 84 aa9.25□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 H3BRM9 83 aa9.25□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.25□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 CKS1BP61024 79 aa9.25□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 STPG4Q8N801 248 aa9.25□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.24□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 DPM2O94777 84 aa9.24□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 SPINK8P0C7L1 97 aa9.24□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 ATOH7Q8N100 152 aa9.24□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 C11orf86A6NJI1 115 aa9.23□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 PLNP26678 52 aa9.23□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 COX7B2Q8TF08 81 aa9.23□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 MYCBP2O75592 4640 aa9.22□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 IGKCP01834 107 aa9.22□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 CXCL5P42830 114 aa9.22□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 S100A12P80511 92 aa9.22□□□□□ -0.93
TSTA3-208ENST00000528920 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.21□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 Q6ZRP5 223 aa9.21□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 VAMP8Q9BV40 100 aa9.21□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.2□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.2□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 A0A1W2PNN7 141 aa9.19□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.18□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 GAGE2EQ4V326 116 aa9.18□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 C7orf33Q8WU49 177 aa9.18□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.18□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.18□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 J3QL48 77 aa9.17□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 SPATA45Q537H7 98 aa9.16□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 TMEM223A0PJW6 202 aa9.15□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.15□□□□□ -0.94
TSTA3-208ENST00000528920 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TSTA3-208ENST00000528920 FAM168BA1KXE4 195 aa9.13□□□□□ -0.95
TSTA3-208ENST00000528920 E9PLD3 99 aa9.11□□□□□ -0.95
TSTA3-208ENST00000528920 HERVK_113P61574 105 aa9.11□□□□□ -0.95
TSTA3-208ENST00000528920 SFTA2Q6UW10 78 aa9.11□□□□□ -0.95
TSTA3-208ENST00000528920 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TSTA3-208ENST00000528920 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.11□□□□□ -0.95
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TSTA3-208ENST00000528920 PRO1933Q9H354 126 aa9.11□□□□□ -0.95
TSTA3-208ENST00000528920 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.5 ms