RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528149.5

CCDC90B-210, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC90B, Length 987 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90B-210ENST00000528149 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.5□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 FAM229AH3BQW9 127 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 SLPIP03973 132 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 S100A2P29034 98 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.49□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 C3orf79P0CE67 100 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 KRTDAPP60985 99 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.48□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 H3BRM9 83 aa7.47□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.47□□□□□ -1.21
CCDC90B-210ENST00000528149 C5orf52A6NGY3 159 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 CARD19Q96LW7 228 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.46□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 DPM2O94777 84 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 SYCNQ0VAF6 134 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 KIAA0087Q14695 138 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 LINC01545Q5VT33 79 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 Q6ZRU5 148 aa7.45□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 IGKCP01834 107 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 PRSS2P07478 247 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 GCSHP23434 173 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 PLNP26678 52 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 PET117Q6UWS5 81 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 C2orf82Q6UX34 121 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 Q8IZM0 81 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 COX7B2Q8TF08 81 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 C2orf48Q96LS8 159 aa7.44□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 TMEM223A0PJW6 202 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 NDUFA1O15239 70 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 C10orf25Q5T742 122 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 LRP2P98164 4655 aa7.43□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.42□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 C20orf202A1L168 122 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 PANO1I0J062 215 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 CKS1BP61024 79 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 ATOH7Q8N100 152 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.41□□□□□ -1.22
CCDC90B-210ENST00000528149 F8WDY8 70 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 CHTF8P0CG12 524 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 CXCL5P42830 114 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 HERVK_113P61574 105 aa7.39□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.38□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.38□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 A0A096LNI7 61 aa7.37□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.37□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.37□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 LEPROTO15243 131 aa7.37□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 RNF151Q2KHN1 245 aa7.37□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 STPG4Q8N801 248 aa7.37□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 GAGE2BQ13066 116 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 LCE2CQ5TA81 110 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 Q6ZSA8 131 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.36□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 E9PLD3 99 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 J3QQQ9 107 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 SCXQ7RTU7 201 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.35□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 SCGB1D1O95968 90 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 PTTG1IPP53801 180 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 MAJINQ3KP22 176 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.34□□□□□ -1.23
CCDC90B-210ENST00000528149 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC90B-210ENST00000528149 GAGE2EQ4V326 116 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC90B-210ENST00000528149 Q6ZRP5 223 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC90B-210ENST00000528149 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC90B-210ENST00000528149 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.33□□□□□ -1.24
CCDC90B-210ENST00000528149 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC90B-210ENST00000528149 PFN2P35080 140 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC90B-210ENST00000528149 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC90B-210ENST00000528149 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC90B-210ENST00000528149 ERG28Q9UKR5 140 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.3 ms