RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528058.1

SIGIRR-211, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 4

Gene SIGIRR, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-211ENST00000528058 RTL8CO15255 209 aa9.5□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 COX8AP10176 69 aa9.5□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 HERV-K104P63124 156 aa9.5□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.49□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 A0A087WTM6 91 aa9.49□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.49□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 WFDC2Q14508 124 aa9.49□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.49□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.49□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.49□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.48□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.48□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.47□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 CKS1BP61024 79 aa9.47□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 RNF151Q2KHN1 245 aa9.47□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.47□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 PCP2Q8IVA1 136 aa9.47□□□□□ -0.89
SIGIRR-211ENST00000528058 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.46□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 Q8N814 137 aa9.46□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 ZNF815PA8K554 130 aa9.45□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 LINC00587B1AMM8 73 aa9.45□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 TIMM17BO60830 172 aa9.45□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.45□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 LECT2O14960 151 aa9.44□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 SYCNQ0VAF6 134 aa9.44□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 COX17Q14061 63 aa9.44□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.44□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 A0A0J9YXY3 114 aa9.43□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 SLPIP03973 132 aa9.43□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 C2orf82Q6UX34 121 aa9.43□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 CARD19Q96LW7 228 aa9.43□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.43□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 HIGD1BQ9P298 99 aa9.43□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.43□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 EREGO14944 169 aa9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 TNP2Q05952 138 aa9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 C10orf25Q5T742 122 aa9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 Q6ZRU5 148 aa9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 C14orf144Q96I85 54 aa9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.42□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.41□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.41□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.41□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 TSTD3H0UI37 97 aa9.4□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 LITAFQ99732 161 aa9.4□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 ERG28Q9UKR5 140 aa9.4□□□□□ -0.9
SIGIRR-211ENST00000528058 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.39□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.39□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 Q6ZVH6 145 aa9.39□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.39□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.39□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 TMEM238C9JI98 176 aa9.38□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 PTTG1IPP53801 180 aa9.38□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.37□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.37□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 SPANXCQ9NY87 97 aa9.37□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 PKD1P98161 4303 aa9.36□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.36□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 GCSHP23434 173 aa9.36□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.36□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.36□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.36□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.35□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.35□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.34□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 SMIM13P0DJ93 91 aa9.34□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 TAL2Q16559 108 aa9.34□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 PRO1933Q9H354 126 aa9.34□□□□□ -0.91
SIGIRR-211ENST00000528058 A0A1B0GVY2 172 aa9.33□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 IFITM1P13164 125 aa9.33□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.33□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 COPS9Q8WXC6 57 aa9.33□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.32□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.32□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 LINC00158P58513 81 aa9.32□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.32□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 C16orf90A8MZG2 172 aa9.31□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 PFN2P35080 140 aa9.31□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.31□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 Q6ZRP5 223 aa9.31□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 KRTAP10-2P60368 255 aa9.3□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 HSD52Q0P140 79 aa9.3□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.3□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 DDTP30046 118 aa9.29□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.29□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.29□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.28□□□□□ -0.92
SIGIRR-211ENST00000528058 NDUFC2O95298 119 aa9.27□□□□□ -0.93
SIGIRR-211ENST00000528058 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
SIGIRR-211ENST00000528058 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms