RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 KLLNB2CW77 178 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFA1O15239 70 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 GHRHP01286 108 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 NCR3O14931 201 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 COX6A2Q02221 97 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf85Q96MD7 179 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 FAM236CP0DP71 79 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 KNCNA6PVL3 124 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV1-51P01701 117 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0U1RQV1 116 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFC2O95298 119 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 EPM2AB3EWF7 344 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 SLPIP03973 132 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 XCL1P47992 114 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 XCL2Q9UBD3 114 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 H7BZZ5 65 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.16□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 PRM2P04554 102 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 SEC61GP60059 68 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 ENHOQ6UWT2 76 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZSN1 163 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 K7EQG2 157 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 INSP01308 110 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 KLK9Q2XQG4 91 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 LECT2O14960 151 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV2D-28P01615 120 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF415Q09FC8 603 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 SS18Q15532 418 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 BRK1Q8WUW1 75 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 SNURFQ9Y675 71 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 CRPP02741 224 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB135Q30KP9 77 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 RMI2Q96E14 147 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 HTN3P15516 51 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 V9GYY9 64 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 CCKP06307 115 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf195Q5TG92 126 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-211ENST00000520276 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 COPS9Q8WXC6 57 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 NF1P21359 2839 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 F8WEM9 126 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.07□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZTI0 123 aa7.07□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.07□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.06□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.06□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 NOTCH1P46531 2555 aa7.06□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB130BP0DP73 79 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 DEFB130AP0DP74 79 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 KLKP1Q107X0 134 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 DAD1P61803 113 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-211ENST00000520276 H0YGX0 51 aa7.04□□□□□ -1.28
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