RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEC11AP67812 179 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MNS1Q8NEH6 495 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPEF2Q9C093 1822 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-3.07□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A087WVE0 104 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MT2AP02795 61 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MT1BP07438 61 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLC1P0CG04 106 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RGS21Q2M5E4 152 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q6ZUT4 128 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PARVGQ9HBI0 331 aa-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCN11AQ9UI33 1791 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CSMD2Q7Z408 3487 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPTSSAQ969W0 71 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNCGO76070 127 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 REEP5Q00765 189 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSLPQ969D9 159 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MGST2Q99735 147 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SHROOM2Q13796 1616 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NDUFB6O95139 128 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM223AQ8IWN6 122 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRO1933Q9H354 126 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAR1AQ9NR31 198 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1B0GU69 56 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAIMQ9NVQ4 179 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H7BZZ5 65 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PFDN1O60925 122 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C5orf38Q86SI9 138 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLIP1P30622 1438 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAC4Q86UU9 113 aa-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CEP152O94986 1710 aa-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADGRL2O95490 1459 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNFSF15O95150 251 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NCS1P62166 190 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRLHP81277 87 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BOLA2Q9H3K6 86 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCTE3Q8IZS6 198 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COPZ2Q9P299 210 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HIGD1AQ9Y241 93 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CUX1P39880 1505 aa-3.16□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCHHQ07283 1943 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCTP09683 121 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNCAP37840 140 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-3.17□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PREX1Q8TCU6 1659 aa-3.18□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEFHP12036 1026 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAMD13Q5VXD3 122 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-3.19□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAPKBP1O60336 1514 aa-3.2□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1B0GX51 115 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATPIF1Q9UII2 106 aa-3.21□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM128Q5BJH2 165 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 V9GYQ6 96 aa-3.22□□□□□ -2.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ROCK1Q13464 1354 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLXNC1O60486 1568 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLC6P0CF74 106 aa-3.23□□□□□ -2.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FREM2Q5SZK8 3169 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM223BA6NKX1 122 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NDUFA3O95167 84 aa-3.24□□□□□ -2.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-3.24□□□□□ -2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms