RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	APOM	O95445	188 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	MUC2	Q02817	5179 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB4A	P20338	218 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	FCER1G	P30273	86 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GW15	77 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	MT-ND6	P03923	174 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PDE4D-222	ENST00000514552	LPA	P08519	4548 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1W2PNN7	141 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552		H0Y9J4	135 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFA1	O15239	70 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6ZUT4	128 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552		V9GYV3	84 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	S100A8	P05109	93 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	S100A6	P06703	90 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	PPBP	P02775	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	CEBPG	P53567	150 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	HBB	P68871	147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552		F8W036	122 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	CKS2	P33552	79 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552		M0QXV9	152 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GXF2	115 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PDE4D-222	ENST00000514552		D6R8Y8	96 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PDE4D-222	ENST00000514552	UBE2D1	P51668	147 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PDE4D-222	ENST00000514552	CTAG1A	P78358	180 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PDE4D-222	ENST00000514552	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PDE4D-222	ENST00000514552	ADIRF	Q15847	76 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PDE4D-222	ENST00000514552	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PDE4D-222	ENST00000514552	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PDE4D-222	ENST00000514552	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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