RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
UBE2B-208ENST00000511807 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.46□□□□□ -1.21
UBE2B-208ENST00000511807 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.46□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 HERVK_113P61574 105 aa7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 C14orf177Q52M58 125 aa7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 Q8N814 137 aa7.44□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM223A0PJW6 202 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 SPINK8P0C7L1 97 aa7.43□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 USP17L23D6RBM5 183 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS2P07478 247 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 ATOH7Q8N100 152 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.42□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.41□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.41□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.41□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.41□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 F8WDY8 70 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 LECT2O14960 151 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 SPAG11BQ08648 103 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 WFDC2Q14508 124 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 PYY3Q5JQD4 70 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 Q8IZM0 81 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 STPG4Q8N801 248 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 C15orf56Q8N910 161 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 COX7B2Q8TF08 81 aa7.4□□□□□ -1.22
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 hDV102S1A0JD36 115 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 E9PLD3 99 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 LEPROTO15243 131 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.39□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 CXCL5P42830 114 aa7.38□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 CKS1BP61024 79 aa7.38□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 C2orf48Q96LS8 159 aa7.38□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 J3QQQ9 107 aa7.37□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA0087Q14695 138 aa7.37□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 XP32Q5T750 250 aa7.37□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 SFTA2Q6UW10 78 aa7.37□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.37□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 VAMP8Q9BV40 100 aa7.37□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFA1O15239 70 aa7.36□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 S100A12P80511 92 aa7.36□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 LINC01620Q4KN68 170 aa7.36□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 HERC1Q15751 4861 aa7.36□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.35□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM6P0DI80 62 aa7.35□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 NMUP48645 174 aa7.35□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 SYCNQ0VAF6 134 aa7.35□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 MAJINQ3KP22 176 aa7.35□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.35□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.35□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 HERV-K104P63124 156 aa7.34□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZSA8 131 aa7.34□□□□□ -1.23
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.34□□□□□ -1.23
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UBE2B-208ENST00000511807 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.33□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 RNF151Q2KHN1 245 aa7.33□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 SPATA45Q537H7 98 aa7.33□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 C2orf82Q6UX34 121 aa7.33□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.33□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 CARD19Q96LW7 228 aa7.33□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.33□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.32□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00587B1AMM8 73 aa7.32□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.32□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZRU5 148 aa7.32□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 SCXQ7RTU7 201 aa7.32□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF815PA8K554 130 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 SLPIP03973 132 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 FAT1Q14517 4588 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 C10orf25Q5T742 122 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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UBE2B-208ENST00000511807 COX17Q14061 63 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 PCP2Q8IVA1 136 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 MYCBP2O75592 4640 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 DLEU1O43261 78 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-208ENST00000511807 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.28□□□□□ -1.24
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