RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148	TNXB	P22105	4242 aa		10.48	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148		A0A087WYN8	130 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148	PRSS2	P07478	247 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148	KIAA0087	Q14695	138 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.47	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148	SCO1	O75880	301 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFA6	P56556	154 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148		Q8IZM0	81 aa		10.46	□□□□□ -0.73
MIB2-223	ENST00000508148	PTTG1IP	P53801	180 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		10.45	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	IGLC3	P0DOY3	106 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148		H3BRM9	83 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	CKS1B	P61024	79 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	GAGE2B	Q13066	116 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	C10orf25	Q5T742	122 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	STPG4	Q8N801	248 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	SERF1A	O75920	110 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	CXCL5	P42830	114 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	C2orf82	Q6UX34	121 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	SPINK8	P0C7L1	97 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00310	P59036	64 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148		F8VRH5	84 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	LRP2	P98164	4655 aa		10.39	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	LEPROTL1	O95214	131 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	ODF1	Q14990	250 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	COX7B2	Q8TF08	81 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	C7orf33	Q8WU49	177 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf86	A6NJI1	115 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZRP5	223 aa		10.37	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BK	O60814	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	S100A1	P23297	94 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BO	P23527	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BB	P33778	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BD	P58876	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BC	P62807	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	GAGE2E	Q4V326	116 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MIB2-223	ENST00000508148	NUPR1	O60356	82 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148		H0Y8G0	127 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	ATP6V1G1	O75348	118 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1W2PNN7	141 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	SFTA2	Q6UW10	78 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	FABP4	P15090	132 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	LINC01600	Q96MT4	127 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	RNF213	Q63HN8	5207 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM223	A0PJW6	202 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	PLN	P26678	52 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MIB2-223	ENST00000508148	FAM168B	A1KXE4	195 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148		M0QXV9	152 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	DPM2	O94777	84 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP10-8	P60410	259 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	COX17	Q14061	63 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	ERG28	Q9UKR5	140 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	IGKC	P01834	107 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	PFN2	P35080	140 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	HERVK_113	P61574	105 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MIB2-223	ENST00000508148	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MIB2-223	ENST00000508148	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2B	P63146	152 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MIB2-223	ENST00000508148	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MIB2-223	ENST00000508148	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MIB2-223	ENST00000508148	LEPROT	O15243	131 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MIB2-223	ENST00000508148	HERV-K104	P63124	156 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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