RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	SH2D1A	O60880	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	TSHB	P01222	138 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	COX6C	P09669	75 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	GNRH2	O43555	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2D1	P51668	147 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971		Q6ZSN1	163 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A087WW49	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971		K7ERS5	55 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	PRR4	Q16378	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971		Q86TA4	180 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	SMR3A	Q99954	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	SOCS3	O14543	225 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971		V9GYV3	84 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971		M0R3E3	92 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	PROK1	P58294	105 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	MIF	P14174	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971		F8WEM9	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	MIA	Q16674	131 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	CRIP1	P50238	77 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	ACAN	P16112	2415 aa		4.65	□□□□□ -1.66
FBXO38-208	ENST00000504971	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971		A8MTW9	85 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FBXO38-208	ENST00000504971	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms