RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXD10-202ENST00000490088 COX7B2Q8TF08 81 aa13.92□□□□□ -0.18
HOXD10-202ENST00000490088 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa13.91□□□□□ -0.18
HOXD10-202ENST00000490088 F8WDY8 70 aa13.91□□□□□ -0.18
HOXD10-202ENST00000490088 CKS1BP61024 79 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXD10-202ENST00000490088 LINC01545Q5VT33 79 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXD10-202ENST00000490088 SDIM1Q6ZPB5 146 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXD10-202ENST00000490088 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
HOXD10-202ENST00000490088 FAM30AQ9NZY2 134 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXD10-202ENST00000490088 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXD10-202ENST00000490088 CXCL5P42830 114 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXD10-202ENST00000490088 RNF151Q2KHN1 245 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXD10-202ENST00000490088 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD10-202ENST00000490088 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD10-202ENST00000490088 C20orf202A1L168 122 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXD10-202ENST00000490088 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 Q6ZSA8 131 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 PANO1I0J062 215 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 CHTF8P0CG12 524 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 HAMPP81172 84 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 A0A096LNI7 61 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 HERVK_113P61574 105 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 DNAH8Q96JB1 4490 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 LEPROTO15243 131 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 GAGE2BQ13066 116 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 CDK2AP2O75956 126 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 XGP55808 180 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 TSPEAR-AS2P59090 65 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 ATOH7Q8N100 152 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 STPG4Q8N801 248 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXD10-202ENST00000490088 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 PTTG1IPP53801 180 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 Q6ZRP5 223 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 SPACA4Q8TDM5 124 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 E9PLD3 99 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 MAJINQ3KP22 176 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 SCXQ7RTU7 201 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 DPH3Q96FX2 82 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 J3QQQ9 107 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 GAGE2EQ4V326 116 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 SFTA2Q6UW10 78 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 LINC00474Q9P2X8 69 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 AKR1D1P51857 326 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 ERG28Q9UKR5 140 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXD10-202ENST00000490088 A0A087WYN8 130 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 SCGB1D1O95968 90 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 PFN2P35080 140 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 HERV-K104P63124 156 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 NMUP48645 174 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 XAGE1AQ9HD64 81 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 PLAC8Q9NZF1 115 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 RYR1P21817 5038 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 HSPG2P98160 4391 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 A0A0U1RRA0 63 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 A0A1W2PNN7 141 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 COX17Q14061 63 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 MEIG1Q5JSS6 88 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXD10-202ENST00000490088 LINC00158P58513 81 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 FAM168BA1KXE4 195 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 SMIM13P0DJ93 91 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 HSBP1L1C9JCN9 74 aa13.61□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF815PA8K554 130 aa13.6□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 A0A0J9YXY3 114 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 LINC00587B1AMM8 73 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.59□□□□□ -0.23
HOXD10-202ENST00000490088 EPM2AB3EWF7 344 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa13.58□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 PCP2Q8IVA1 136 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 LINC00528Q8N1L1 170 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 DAND5Q8N907 189 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 PYY3Q5JQD4 70 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 Q8N1X5 172 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXD10-202ENST00000490088 HERC2O95714 4834 aa13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms