RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, human

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GARNL3-218	ENST00000487565	C5orf38	Q86SI9	138 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565		A0A087WZ39	114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	APOM	O95445	188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	SPINK8	P0C7L1	97 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	COX6A2	Q02221	97 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	ATOH7	Q8N100	152 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	DNAH2	Q9P225	4427 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	LECT2	O14960	151 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	SPAG11B	Q08648	103 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	CFAP161	Q6P656	301 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	PRSS2	P07478	247 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	C14orf177	Q52M58	125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	C15orf56	Q8N910	161 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	hDV102S1	A0JD36	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	PYY3	Q5JQD4	70 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	KMT2A	Q03164	3969 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	RTL8C	O15255	209 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	SMIM6	P0DI80	62 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	WFDC2	Q14508	124 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565		Q8IZM0	81 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	STPG4	Q8N801	248 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	COX7B2	Q8TF08	81 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	VAMP8	Q9BV40	100 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GARNL3-218	ENST00000487565	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565		A0A087WTM6	91 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565		E9PLD3	99 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	LEPROT	O15243	131 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	CXCL5	P42830	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	CKS1B	P61024	79 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565		J3QQQ9	107 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	NMU	P48645	174 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	MAJIN	Q3KP22	176 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	SFTA2	Q6UW10	78 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565		Q8N814	137 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	C2orf48	Q96LS8	159 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	RYR3	Q15413	4870 aa		5	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565		F8WDY8	70 aa		5	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	NDUFA1	O15239	70 aa		5	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	S100A12	P80511	92 aa		5	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	SPATA45	Q537H7	98 aa		5	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	CARD19	Q96LW7	228 aa		5	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	HERV-K104	P63124	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565		Q6ZRU5	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GARNL3-218	ENST00000487565	COX8A	P10176	69 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	C12orf57	Q99622	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GARNL3-218	ENST00000487565	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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