RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRD-210ENST00000481079 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRD-210ENST00000481079 HMCN2Q8NDA2 5059 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00310P59036 64 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 GAGE2BQ13066 116 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 RNF151Q2KHN1 245 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 F8WDY8 70 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 NUPR1O60356 82 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 A0A1W2PNN7 141 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 MT1HL1P0DM35 61 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 KIAA0087Q14695 138 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 C10orf25Q5T742 122 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 IFI27L1Q96BM0 104 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BKO60814 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BJP06899 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BOP23527 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BBP33778 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BDP58876 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BCP62807 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 TNXBP22105 4242 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 NDUFA1O15239 70 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 PRSS2P07478 247 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 IGLC3P0DOY3 106 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 TOMM7Q9P0U1 55 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRD-210ENST00000481079 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 LEPROTL1O95214 131 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 C6orf226Q5I0X4 101 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 C6orf48Q9UBA6 75 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 H3BRM9 83 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 C2orf82Q6UX34 121 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 SPINK8P0C7L1 97 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 TLX1NBP0CAT3 122 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 FABP4P15090 132 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 CKS1BP61024 79 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 Q8IZM0 81 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 Q6ZRP5 223 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRD-210ENST00000481079 C11orf86A6NJI1 115 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 COX7B2Q8TF08 81 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 H0Y8G0 127 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 F8VRH5 84 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRD-210ENST00000481079 FAM168BA1KXE4 195 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 SPINK6Q6UWN8 80 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 CXCL5P42830 114 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 LINC01600Q96MT4 127 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 ODF1Q14990 250 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 GAGE2EQ4V326 116 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM223A0PJW6 202 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRD-210ENST00000481079 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 PLNP26678 52 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 REG3GQ6UW15 175 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 DPM2O94777 84 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 C1orf137Q5JT78 98 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP10-8P60410 259 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRD-210ENST00000481079 M0QXV9 152 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRD-210ENST00000481079 IGKCP01834 107 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRD-210ENST00000481079 SFTA2Q6UW10 78 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRD-210ENST00000481079 UBR4Q5T4S7 5183 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRD-210ENST00000481079 IGLV7-43P04211 117 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRD-210ENST00000481079 PET117Q6UWS5 81 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRD-210ENST00000481079 XAGE1AQ9HD64 81 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRD-210ENST00000481079 C3orf79P0CE67 100 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 PFN2P35080 140 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 KRTDAPP60985 99 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 HERVK_113P61574 105 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRD-210ENST00000481079 ERG28Q9UKR5 140 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms