RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460618.1

UTRN-210, Transcript of utrophin, humanhuman

TSL 5

Gene UTRN, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRN-210ENST00000460618 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 C2orf48Q96LS8 159 aa6.96□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.96□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 LINC00587B1AMM8 73 aa6.95□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.95□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 TMEM238C9JI98 176 aa6.94□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 C2orf82Q6UX34 121 aa6.94□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.94□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 HIGD1BQ9P298 99 aa6.94□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 A0A0J9YXY3 114 aa6.93□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.93□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 TIMM17BO60830 172 aa6.93□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.93□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.93□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 LECT2O14960 151 aa6.92□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 GCSHP23434 173 aa6.92□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 DDTP30046 118 aa6.92□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 SYCNQ0VAF6 134 aa6.92□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.92□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 EREGO14944 169 aa6.91□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 COX17Q14061 63 aa6.91□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.91□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 CARD19Q96LW7 228 aa6.91□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 ERG28Q9UKR5 140 aa6.91□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.9□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.9□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 TAL2Q16559 108 aa6.9□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 RNF151Q2KHN1 245 aa6.9□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.9□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 Q6ZVH6 145 aa6.9□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 COPS9Q8WXC6 57 aa6.9□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 HIST1H4GQ99525 98 aa6.9□□□□□ -1.3
UTRN-210ENST00000460618 LINC00158P58513 81 aa6.89□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 HSD52Q0P140 79 aa6.89□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 WFDC2Q14508 124 aa6.89□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 Q6ZRU5 148 aa6.89□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.89□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 SPANXCQ9NY87 97 aa6.89□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.89□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.88□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 A0A087WTM6 91 aa6.88□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 SMIM13P0DJ93 91 aa6.88□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 PFN2P35080 140 aa6.88□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 C10orf25Q5T742 122 aa6.88□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 Q8N814 137 aa6.88□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.88□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 M0R143 59 aa6.87□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 IFITM1P13164 125 aa6.87□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 LITAFQ99732 161 aa6.87□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 A0A0U1RRA0 63 aa6.86□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.86□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 CTAG1AP78358 180 aa6.86□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.86□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.86□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.85□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.85□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 A6NJY4 79 aa6.85□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 RTL8CO15255 209 aa6.85□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.85□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 SLPIP03973 132 aa6.84□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.84□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 PTTG1IPP53801 180 aa6.84□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.84□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 CEND1Q8N111 149 aa6.84□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 DAND5Q8N907 189 aa6.84□□□□□ -1.31
UTRN-210ENST00000460618 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 TNP2Q05952 138 aa6.83□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.83□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.83□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.83□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 NPC2P61916 151 aa6.82□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.82□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.82□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.81□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 A6NDN8 102 aa6.81□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.81□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.81□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 LYSTQ99698 3801 aa6.81□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.8□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 GAGE2EQ4V326 116 aa6.8□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 Q6ZRP5 223 aa6.8□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.8□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 A4D1N5 150 aa6.79□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 FXYD2P54710 66 aa6.79□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 BATFQ16520 125 aa6.79□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.79□□□□□ -1.32
UTRN-210ENST00000460618 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms