RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 CXCL5P42830 114 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-207ENST00000454947 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-207ENST00000454947 ATOH7Q8N100 152 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-207ENST00000454947 COX7B2Q8TF08 81 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-207ENST00000454947 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP4-207ENST00000454947 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 SMIM6P0DI80 62 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 GCSHP23434 173 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP10-2P60368 255 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 HERVK_113P61574 105 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 MAJINQ3KP22 176 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 SFTA2Q6UW10 78 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 J3QQQ9 107 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFA1O15239 70 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 PRSS2P07478 247 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF151Q2KHN1 245 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 C10orf25Q5T742 122 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 NMUP48645 174 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 SYCNQ0VAF6 134 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 C2orf82Q6UX34 121 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZRU5 148 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.444e-7■■■■□ 23.7
SH3BP4-207ENST00000454947 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 CARD19Q96LW7 228 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.04□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 DLEU1O43261 78 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 CKS1BP61024 79 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 HERV-K104P63124 156 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 PCP2Q8IVA1 136 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 VAMP8Q9BV40 100 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP4-207ENST00000454947 RYR1P21817 5038 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 COX8AP10176 69 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 LITAFQ99732 161 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A0J9YXY3 114 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 TIMM17BO60830 172 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP10-1P60331 282 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 COX17Q14061 63 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 SPATA45Q537H7 98 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZSA8 131 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 ERG28Q9UKR5 140 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF815PA8K554 130 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC01620Q4KN68 170 aa6□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 EPM2AB3EWF7 344 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 CDK2AP2O75956 126 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 Q6ZRP5 223 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 DPH3Q96FX2 82 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00587B1AMM8 73 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 PTTG1IPP53801 180 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 S100A12P80511 92 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.98□□□□□ -1.45
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SH3BP4-207ENST00000454947 PANO1I0J062 215 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 SMIM13P0DJ93 91 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 C12orf57Q99622 126 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 HSPG2P98160 4391 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4-207ENST00000454947 GAGE2BQ13066 116 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 C14orf144Q96I85 54 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 SPANXCQ9NY87 97 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 HIGD1BQ9P298 99 aa5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 PFN2P35080 140 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 FAT1Q14517 4588 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP4-207ENST00000454947 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.95□□□□□ -1.46
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