RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 C11orf86A6NJI1 115 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 DPM2O94777 84 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 IGLC3P0DOY3 106 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 FOXI1Q12951 378 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 ATOH7Q8N100 152 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 C15orf56Q8N910 161 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 IGKCP01834 107 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 PLNP26678 52 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 SEC11AP67812 179 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 PYY3Q5JQD4 70 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 MT1HL1P0DM35 61 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 MALP21145 153 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 COX6A2Q02221 97 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 HERVK_113P63121 156 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 DPH3Q96FX2 82 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 COX7A2LO14548 114 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 C7orf33Q8WU49 177 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 SLPIP03973 132 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 C5orf38Q86SI9 138 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 LRP2P98164 4655 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 H3BRM9 83 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 SMIM6P0DI80 62 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 MAJINQ3KP22 176 aa7.42□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 RNF213Q63HN8 5207 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 SPINK8P0C7L1 97 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 HERVK_113P61574 105 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 STPG4Q8N801 248 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 VAMP8Q9BV40 100 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WZ39 114 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 TMEM223A0PJW6 202 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 PANO1I0J062 215 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 APOMO95445 188 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 CHTF8P0CG12 524 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 CARD19Q96LW7 228 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-210ENST00000442481 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 SPAG11BQ08648 103 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 SYCNQ0VAF6 134 aa7.39□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WYN8 130 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 SPATA45Q537H7 98 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.38□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 E9PLD3 99 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 NMUP48645 174 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 S100A12P80511 92 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 C12orf57Q99622 126 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.37□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 REG3GQ6UW15 175 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 LINC01600Q96MT4 127 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 A0A096LNI7 61 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 LEPROTO15243 131 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 TNXBP22105 4242 aa7.35□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 J3QQQ9 107 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 PRSS2P07478 247 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 GAGE2BQ13066 116 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 COX7B2Q8TF08 81 aa7.34□□□□□ -1.23
PRAME-210ENST00000442481 C2orf48Q96LS8 159 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.33□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 NDUFA1O15239 70 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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