RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439790.5

LINC00460-202, long intergenic non-protein coding RNA 460, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00460, Length 497 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00460-202ENST00000439790 A8MTW9 85 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 IGHV3-53P01767 116 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 XCL1P47992 114 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 C3orf56Q8N813 242 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 XCL2Q9UBD3 114 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 C22orf24Q9Y442 160 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 V9GYY9 64 aa5.07□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 G3V318 75 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 RS1O15537 224 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 SAA4P35542 130 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 CXCL6P80162 114 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 CFHR3Q02985 330 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 CCL19Q99731 98 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 LINC00846Q9NV44 126 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.06□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 PLXNB1O43157 2135 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 SPRY2O43597 315 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 FAM104AQ969W3 186 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 DSCR8Q96T75 97 aa5.05□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 J3QLI3 93 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 K7EQG2 157 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 CR1P17927 2039 aa5.04□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 F6UB75 175 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 H7BZZ5 65 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 LYNX1P0DP58 116 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 FHL2Q14192 279 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 TMEM86BQ8N661 226 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.03□□□□□ -1.6
LINC00460-202ENST00000439790 A0A096LNT2 108 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 SEC61GP60059 68 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 BLCAPP62952 87 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 LCE4AQ5TA78 99 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 C1orf195Q5TG92 126 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 Q8N2B8 174 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 MUC4Q99102 2169 aa5.02□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 A0A1B0GW54 56 aa5.01□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 TRBV12-3P01733 135 aa5.01□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.01□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 Q6ZSV7 163 aa5.01□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.01□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 C20orf197Q8N268 126 aa5.01□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.01□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.01□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.01□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 A6NDX4 124 aa5□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 K7EQD1 137 aa5□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 OXTP01178 125 aa5□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 COX17Q14061 63 aa5□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 LINC00482Q8N8I6 264 aa5□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 COX7B2Q8TF08 81 aa5□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 UBE2L6O14933 153 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 INSP01308 110 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 C16orf95Q9H693 158 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 LYRM9A8MSI8 78 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 LECT2O14960 151 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 Q8N814 137 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 Q9HAA7 133 aa4.98□□□□□ -1.61
LINC00460-202ENST00000439790 PLCE1Q9P212 2302 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms