RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439059.2

AL590683.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AL590683.1, Length 1,849 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL590683.1-201ENST00000439059 C14orf177Q52M58 125 aa8.37□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 CXCL5P42830 114 aa8.36□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.36□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.36□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.36□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 NDUFA1O15239 70 aa8.36□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.36□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.36□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.35□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 A0A087WTM6 91 aa8.35□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 RTL8CO15255 209 aa8.35□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 SFTA2Q6UW10 78 aa8.35□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 C2orf48Q96LS8 159 aa8.35□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 SYCNQ0VAF6 134 aa8.34□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.34□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 C10orf25Q5T742 122 aa8.34□□□□□ -1.07
AL590683.1-201ENST00000439059 TSTD3H0UI37 97 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 EREGO14944 169 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 HERV-K104P63124 156 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 TNP2Q05952 138 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 Q8N814 137 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 A0A0J9YXY3 114 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 A0A0U1RRA0 63 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 DLEU1O43261 78 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 Q6ZRU5 148 aa8.33□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 RYR2Q92736 4967 aa8.32□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 F8WDY8 70 aa8.32□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 SLPIP03973 132 aa8.32□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 PFN2P35080 140 aa8.32□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 CARD19Q96LW7 228 aa8.32□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.31□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.31□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 LINC00158P58513 81 aa8.31□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.31□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 ERG28Q9UKR5 140 aa8.31□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 LINC00587B1AMM8 73 aa8.3□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 SMIM13P0DJ93 91 aa8.3□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 COX17Q14061 63 aa8.28□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 DAND5Q8N907 189 aa8.28□□□□□ -1.08
AL590683.1-201ENST00000439059 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.27□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 TMEM238C9JI98 176 aa8.27□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.27□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.27□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 RNF151Q2KHN1 245 aa8.26□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.26□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.26□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 TIMM17BO60830 172 aa8.26□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 NPC2P61916 151 aa8.26□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 HIST1H4GQ99525 98 aa8.26□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 HIGD1BQ9P298 99 aa8.26□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.25□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 LINC01620Q4KN68 170 aa8.25□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.25□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.24□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 GAGE2EQ4V326 116 aa8.24□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.24□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 LITAFQ99732 161 aa8.24□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.24□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 PKD1P98161 4303 aa8.24□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 RYR3Q15413 4870 aa8.24□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.23□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 DDTP30046 118 aa8.23□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 GAGE2BQ13066 116 aa8.23□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 Q6ZRP5 223 aa8.23□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.22□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 CTAG1AP78358 180 aa8.22□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 Q6ZVH6 145 aa8.22□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 GCSHP23434 173 aa8.22□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 KRTAP10-2P60368 255 aa8.22□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.22□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.22□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.22□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 SPANXCQ9NY87 97 aa8.22□□□□□ -1.09
AL590683.1-201ENST00000439059 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.21□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.21□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.21□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.21□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.19□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 TAL2Q16559 108 aa8.19□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 COPS9Q8WXC6 57 aa8.19□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.19□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 IFITM1P13164 125 aa8.19□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 HSD52Q0P140 79 aa8.19□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.19□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 DPH3Q96FX2 82 aa8.19□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.19□□□□□ -1.1
AL590683.1-201ENST00000439059 A0A096LNI7 61 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms