RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.45□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 RAB5AP20339 215 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 CXCL5P42830 114 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 OSTCQ9NRP0 149 aa8.44□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 DAND5Q8N907 189 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.43□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 GAGE10A6NGK3 116 aa8.42□□□□□ -1.06
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NELFE-204ENST00000436289 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.42□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GW15 77 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 SPINK1P00995 79 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 SEC11AP67812 179 aa8.41□□□□□ -1.06
NELFE-204ENST00000436289 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.41□□□□□ -1.06
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NELFE-204ENST00000436289 LINC01551Q86U37 167 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 VCX2Q9H322 139 aa8.39□□□□□ -1.07
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NELFE-204ENST00000436289 PRLHP81277 87 aa8.38□□□□□ -1.07
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NELFE-204ENST00000436289 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 SLC51BQ86UW2 128 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 HERVK_113P63121 156 aa8.37□□□□□ -1.07
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NELFE-204ENST00000436289 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 D6R8Y8 96 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 F8W036 122 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 IGKV2D-28P01615 120 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 S100A8P05109 93 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 AMELXQ99217 191 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 V9GYV3 84 aa8.36□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 TMEM126AQ9H061 195 aa8.35□□□□□ -1.07
NELFE-204ENST00000436289 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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NELFE-204ENST00000436289 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.33□□□□□ -1.08
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NELFE-204ENST00000436289 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.32□□□□□ -1.08
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NELFE-204ENST00000436289 PRSS47A8MTI9 375 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 BLOC1S1P78537 153 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.3□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 TMEM238C9JI98 176 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 M0R2T5 61 aa8.29□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 M0R378 163 aa8.29□□□□□ -1.08
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NELFE-204ENST00000436289 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 COX7B2Q8TF08 81 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.28□□□□□ -1.08
NELFE-204ENST00000436289 IGIPA6NJ69 53 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 K7EMI3 77 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 G0S2P27469 103 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.27□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 PRELID3AQ96N28 172 aa8.27□□□□□ -1.09
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NELFE-204ENST00000436289 VPREB1P12018 145 aa8.25□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.24□□□□□ -1.09
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NELFE-204ENST00000436289 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.24□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GXF2 115 aa8.23□□□□□ -1.09
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NELFE-204ENST00000436289 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 TIMM17AQ99595 171 aa8.22□□□□□ -1.09
NELFE-204ENST00000436289 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-204ENST00000436289 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
NELFE-204ENST00000436289 PCOTHQ58A44 107 aa8.21□□□□□ -1.1
NELFE-204ENST00000436289 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.2□□□□□ -1.1
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