RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431381.5

CITED1-206, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CITED1, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-206ENST00000431381 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 KIAA0087Q14695 138 aa8.67□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 C2orf82Q6UX34 121 aa8.67□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 A0A0J9YXY3 114 aa8.66□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 LINC00587B1AMM8 73 aa8.66□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 DDTP30046 118 aa8.66□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 A0A0U1RRA0 63 aa8.65□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 F8WDY8 70 aa8.65□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 LINC00158P58513 81 aa8.65□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.65□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 C2orf48Q96LS8 159 aa8.65□□□□□ -1.02
CITED1-206ENST00000431381 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.65□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 LCE6AA0A183 80 aa8.64□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 TMEM238C9JI98 176 aa8.64□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 PFN2P35080 140 aa8.64□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 SYCNQ0VAF6 134 aa8.64□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.64□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 HIST1H4GQ99525 98 aa8.64□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 HIGD1BQ9P298 99 aa8.64□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.63□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 CARD19Q96LW7 228 aa8.63□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 ERG28Q9UKR5 140 aa8.63□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 EREGO14944 169 aa8.62□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 TIMM17BO60830 172 aa8.62□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 SMIM13P0DJ93 91 aa8.62□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 CTAG1AP78358 180 aa8.62□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.61□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 WFDC2Q14508 124 aa8.61□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 C10orf25Q5T742 122 aa8.61□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 Q6ZRU5 148 aa8.61□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.6□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 HSD52Q0P140 79 aa8.6□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 A0A087WTM6 91 aa8.59□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.59□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 GCSHP23434 173 aa8.59□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 NPC2P61916 151 aa8.59□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 COX17Q14061 63 aa8.59□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 TAL2Q16559 108 aa8.59□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 DAND5Q8N907 189 aa8.59□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 COPS9Q8WXC6 57 aa8.59□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.59□□□□□ -1.03
CITED1-206ENST00000431381 LYSTQ99698 3801 aa8.58□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 M0R143 59 aa8.58□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.58□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 Q6ZVH6 145 aa8.58□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.58□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 Q8N814 137 aa8.58□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.58□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 SPANXCQ9NY87 97 aa8.58□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 PTTG1IPP53801 180 aa8.57□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 BATFQ16520 125 aa8.57□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 RNF151Q2KHN1 245 aa8.56□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 CEND1Q8N111 149 aa8.56□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 LITAFQ99732 161 aa8.56□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 SLPIP03973 132 aa8.55□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 IFITM1P13164 125 aa8.55□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.55□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.54□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 A6NJY4 79 aa8.54□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 TNP2Q05952 138 aa8.54□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 GAGE2EQ4V326 116 aa8.54□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.54□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.54□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.54□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.53□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.53□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 RTL8CO15255 209 aa8.53□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.53□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.53□□□□□ -1.04
CITED1-206ENST00000431381 GAGE2BQ13066 116 aa8.52□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.52□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 FXYD2P54710 66 aa8.51□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.5□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 A4D1N5 150 aa8.5□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 A6NDN8 102 aa8.5□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.5□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.5□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.49□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 Q6ZRP5 223 aa8.49□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.48□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.48□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 RAB37Q96AX2 223 aa8.48□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.47□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.47□□□□□ -1.05
CITED1-206ENST00000431381 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CITED1-206ENST00000431381 LINC01620Q4KN68 170 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms