RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 C14orf144Q96I85 54 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.1□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 KMT2AQ03164 3969 aa11.09□□□□□ -0.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 EREGO14944 169 aa11.08□□□□□ -0.64
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0J9YXY3 114 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNP2Q05952 138 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF151Q2KHN1 245 aa11.05□□□□□ -0.64
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CARD19Q96LW7 228 aa11.05□□□□□ -0.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.05□□□□□ -0.64
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TOP3BP1-201ENST00000420768 COX17Q14061 63 aa11.03□□□□□ -0.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRO1933Q9H354 126 aa11.03□□□□□ -0.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.03□□□□□ -0.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.01□□□□□ -0.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM238C9JI98 176 aa11□□□□□ -0.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM13P0DJ93 91 aa10.99□□□□□ -0.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 PFN2P35080 140 aa10.99□□□□□ -0.65
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PKIGQ9Y2B9 76 aa10.99□□□□□ -0.65
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa10.97□□□□□ -0.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.97□□□□□ -0.65
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.94□□□□□ -0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.94□□□□□ -0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TAL2Q16559 108 aa10.92□□□□□ -0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DAND5Q8N907 189 aa10.92□□□□□ -0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H4GQ99525 98 aa10.92□□□□□ -0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFITM1P13164 125 aa10.91□□□□□ -0.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTTG1IPP53801 180 aa10.91□□□□□ -0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP10-2P60368 255 aa10.9□□□□□ -0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.9□□□□□ -0.66
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.9□□□□□ -0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.88□□□□□ -0.67
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MUSTN1Q8IVN3 82 aa10.87□□□□□ -0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 XAGE1AQ9HD64 81 aa10.87□□□□□ -0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 RYR2Q92736 4967 aa10.87□□□□□ -0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRAS1Q86XX4 4008 aa10.86□□□□□ -0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPC2P61916 151 aa10.86□□□□□ -0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTAG1AP78358 180 aa10.86□□□□□ -0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEND1Q8N111 149 aa10.86□□□□□ -0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A096LNI7 61 aa10.85□□□□□ -0.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL24P83731 157 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
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