RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CKS1BP61024 79 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6ZRP5 223 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8IZM0 81 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFA6P56556 154 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PDZD11Q5EBL8 140 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE2EQ4V326 116 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 J3QL48 77 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP5LO75964 103 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 TRGC2P03986 189 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP4-204ENST00000416021 SPINK8P0C7L1 97 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLC3P0DOY3 106 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 COX7B2Q8TF08 81 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 COLCA2A8K830 154 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BRM9 83 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 OXTP01178 125 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 BAGE3Q86Y29 109 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 HERC1Q15751 4861 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM168BA1KXE4 195 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 F8VRH5 84 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL5P42830 114 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 FAT3Q8TDW7 4589 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP4-204ENST00000416021 HSBP1O75506 76 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM19A2Q8N3H0 131 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 IFI27L1Q96BM0 104 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf86A6NJI1 115 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 XAGE1AQ9HD64 81 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SERF1AO75920 110 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SCO1O75880 301 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SPINK6Q6UWN8 80 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 M0QXV9 152 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00310P59036 64 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 NUPR1O60356 82 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf137Q5JT78 98 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 LEPROTL1O95214 131 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 C22orf24Q9Y442 160 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2BP63146 152 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM223A0PJW6 202 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 H0Y8G0 127 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PFN2P35080 140 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 FABP4P15090 132 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPB8Q9UJY1 196 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 MT1HL1P0DM35 61 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 ODF1Q14990 250 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV7-43P04211 117 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 REG3GQ6UW15 175 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 ERG28Q9UKR5 140 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 SFTA2Q6UW10 78 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01600Q96MT4 127 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 COX17Q14061 63 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2BKO60814 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2BJP06899 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2BOP23527 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2BBP33778 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2BDP58876 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2BCP62807 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST2H2BEQ16778 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2BHQ93079 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2BNQ99877 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 HIST1H2BMQ99879 126 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00167Q96N53 147 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 PLNP26678 52 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00158P58513 81 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 DIRC1Q969H9 104 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE10A6NGK3 116 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL37AP8A6NKH3 93 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 DPM2O94777 84 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-204ENST00000416021 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.83□□□□□ -0.36
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