RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 KIAA0087Q14695 138 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 C2orf48Q96LS8 159 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 EREGO14944 169 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 C2orf82Q6UX34 121 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0J9YXY3 114 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM238C9JI98 176 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-201ENST00000368202 RYR3Q15413 4870 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00158P58513 81 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 SYCNQ0VAF6 134 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 CARD19Q96LW7 228 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 RYR2Q92736 4967 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 TIMM17BO60830 172 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 PFN2P35080 140 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 HIGD1BQ9P298 99 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 ERG28Q9UKR5 140 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0U1RRA0 63 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 GCSHP23434 173 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 DDTP30046 118 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZRU5 148 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H4GQ99525 98 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 A0A087WTM6 91 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM13P0DJ93 91 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 COX17Q14061 63 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 WFDC2Q14508 124 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 COPS9Q8WXC6 57 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 C10orf25Q5T742 122 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 Q8N814 137 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 HSD52Q0P140 79 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 TAL2Q16559 108 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 RNF151Q2KHN1 245 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZVH6 145 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 SPANXCQ9NY87 97 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-201ENST00000368202 CTAG1AP78358 180 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 NPC2P61916 151 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 TNP2Q05952 138 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 M0R143 59 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 RTL8CO15255 209 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 IFITM1P13164 125 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 PTTG1IPP53801 180 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 DAND5Q8N907 189 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 A6NJY4 79 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 SLPIP03973 132 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 CEND1Q8N111 149 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 LITAFQ99732 161 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE2EQ4V326 116 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 KMT2AQ03164 3969 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 GAGE2BQ13066 116 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 BATFQ16520 125 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZRP5 223 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 A6NDN8 102 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 A4D1N5 150 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 FXYD2P54710 66 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms