RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365490.1

RN7SKP249-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP249, Length 355 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP249-201ENST00000365490 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.36□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 CKS1BP61024 79 aa6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 SYCNQ0VAF6 134 aa6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 RNF151Q2KHN1 245 aa6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPATA45Q537H7 98 aa6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 C10orf25Q5T742 122 aa6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 C2orf82Q6UX34 121 aa6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 PCP2Q8IVA1 136 aa6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.35□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 EREGO14944 169 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 DLEU1O43261 78 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 COX8AP10176 69 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 HERV-K104P63124 156 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 S100A12P80511 92 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 Q6ZRU5 148 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.34□□□□□ -1.39
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.33□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 C12orf57Q99622 126 aa6.33□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.33□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.32□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF815PA8K554 130 aa6.32□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.32□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 CARD19Q96LW7 228 aa6.32□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.32□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A0J9YXY3 114 aa6.31□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A1B0GVY2 172 aa6.31□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC00587B1AMM8 73 aa6.31□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.31□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 COX17Q14061 63 aa6.31□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 C14orf144Q96I85 54 aa6.31□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.31□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 TIMM17BO60830 172 aa6.3□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 KRTAP10-2P60368 255 aa6.3□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 ERG28Q9UKR5 140 aa6.3□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 RYR2Q92736 4967 aa6.3□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.29□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.29□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 LITAFQ99732 161 aa6.29□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 PKD1P98161 4303 aa6.29□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.28□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 HIGD1BQ9P298 99 aa6.28□□□□□ -1.4
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.27□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.27□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 SMIM13P0DJ93 91 aa6.27□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.27□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.27□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.27□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.27□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 PFN2P35080 140 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 PTTG1IPP53801 180 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC00158P58513 81 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 Q6ZRP5 223 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.26□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 C16orf90A8MZG2 172 aa6.25□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 Q6ZVH6 145 aa6.25□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.25□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRO1933Q9H354 126 aa6.25□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.25□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPANXCQ9NY87 97 aa6.25□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.24□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A0U1RRA0 63 aa6.24□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM238C9JI98 176 aa6.24□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 GCSHP23434 173 aa6.24□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC01620Q4KN68 170 aa6.24□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.24□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.24□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A096LNI7 61 aa6.23□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 TSTD3H0UI37 97 aa6.23□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 RYR3Q15413 4870 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 EPM2AB3EWF7 344 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 IFITM1P13164 125 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 KRTAP10-1P60331 282 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 GAGE2BQ13066 116 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 TAL2Q16559 108 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 GAGE2EQ4V326 116 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 DAND5Q8N907 189 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.22□□□□□ -1.41
RN7SKP249-201ENST00000365490 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms