RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.65□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0QY20 66 aa7.65□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
APOBEC3C-201ENST00000361441 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.64□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBN2P35556 2912 aa7.64□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 GNLYP22749 145 aa7.64□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 CACNA1AO00555 2505 aa7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZTC4 211 aa7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.63□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLLNB2CW77 178 aa7.62□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0R378 163 aa7.62□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.62□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 MED14OSP0DP75 135 aa7.62□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 NREPQ16612 68 aa7.62□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.62□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2D-28P01615 120 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV4-59P01825 116 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 H0YGX0 51 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 COX6A2Q02221 97 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLK9Q2XQG4 91 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB136Q30KP8 78 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCXQ7RTU7 201 aa7.61□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 K7EMT4 169 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 AKAP9Q99996 3911 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 A6NDX4 124 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 ACACBO00763 2458 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRYO14603 147 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q1T7F1 81 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.6□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIEZO1Q92508 2521 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTPN13Q12923 2485 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 USMG5Q96IX5 58 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 JMJD1CQ15652 2540 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHD6Q8TD26 2715 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0R2N4 97 aa7.59□□□□□ -1.19
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 C8orf87E5RJ46 101 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCL19Q99731 98 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 NF1P21359 2839 aa7.58□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 hDV103S1A0JD37 113 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 A8MUN3 132 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZSN1 163 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV1-40P01703 118 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYCNQ0VAF6 134 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.57□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.56□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZVQ6 151 aa7.56□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRK2Q5S007 2527 aa7.56□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF843Q8N446 348 aa7.56□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.56□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 BPY2O14599 106 aa7.55□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 K7EQG2 157 aa7.55□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 MSMBP08118 114 aa7.55□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB131AP59861 70 aa7.55□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.55□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.55□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.54□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.54□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.54□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLURP1P55000 103 aa7.54□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCL24O00175 119 aa7.54□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.53□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBE2BP63146 152 aa7.53□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.53□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
APOBEC3C-201ENST00000361441 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 ESM1Q9NQ30 184 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 C16orf90A8MZG2 172 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-53P01767 116 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00158P58513 81 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BUA1 57 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZQT0 140 aa7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms