RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 DIRC1Q969H9 104 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.94□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1B0GV90 55 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 COX6A2Q02221 97 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 FOXI1Q12951 378 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 Q9UF83 564 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 MTURNQ8N3F0 131 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 CFC1BP0CG36 223 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 CFC1P0CG37 223 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 UBE2D1P51668 147 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 Q6ZVH6 145 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 C6orf223Q8N319 242 aa4.93□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A0J9YXY3 114 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 PTH2Q96A98 100 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM223A0PJW6 202 aa4.92□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 C3orf84H3BNL1 204 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC00315P59091 139 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1B0GUV1 79 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 SPANXCQ9NY87 97 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 IGIPA6NJ69 53 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.91□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.9□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 CDPF1Q6NVV7 123 aa4.9□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 DSCR8Q96T75 97 aa4.9□□□□□ -1.62
LRRTM3-201ENST00000361320 H3BNG1 76 aa4.9□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 COX7BP24311 80 aa4.9□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.9□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 Q8N3U1 123 aa4.9□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 VPS13CQ709C8 3753 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 Q8IZM0 81 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 H0YGX0 51 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.89□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.88□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 FXYD2P54710 66 aa4.88□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.88□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 C16orf90A8MZG2 172 aa4.88□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 M0QXV9 152 aa4.88□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 NPSP0C0P6 89 aa4.88□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.88□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 HAMPP81172 84 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 K7EP13 123 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 NF1P21359 2839 aa4.87□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC01620Q4KN68 170 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 C6orf99Q4VX62 202 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 H3BMG7 143 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 YPEL4Q96NS1 127 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 Q6ZRU5 148 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 hADV29S1A0JD25 119 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 C9orf118A6NHY6 69 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 SVIPQ8NHG7 77 aa4.86□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 A8MTW9 85 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 M0R378 163 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 HIGD1BQ9P298 99 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 CLEC2BQ92478 149 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.85□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.84□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 TRACP01848 142 aa4.84□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 ETDBQ3ZM63 59 aa4.84□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 AMELXQ99217 191 aa4.84□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.84□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.84□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 C1orf137Q5JT78 98 aa4.84□□□□□ -1.63
LRRTM3-201ENST00000361320 C2orf48Q96LS8 159 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM3-201ENST00000361320 UBL5Q9BZL1 73 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM3-201ENST00000361320 DLEU1O43261 78 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM3-201ENST00000361320 COX17Q14061 63 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM3-201ENST00000361320 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1W2PPM0 123 aa4.83□□□□□ -1.64
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