RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.56□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 DLEU1O43261 78 aa14.55□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 CXCL5P42830 114 aa14.55□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 TSTD3H0UI37 97 aa14.55□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.55□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 SFTA2Q6UW10 78 aa14.54□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 C2orf48Q96LS8 159 aa14.53□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 HERV-K104P63124 156 aa14.52□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 CAMK2N2Q96S95 79 aa14.52□□□□□ -0.08
CTU2-201ENST00000312060 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.52□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 C14orf177Q52M58 125 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.51□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 A0A0J9YXY3 114 aa14.5□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 F8WDY8 70 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 C10orf25Q5T742 122 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 RYR2Q92736 4967 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 A0A087WTM6 91 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 RTL8CO15255 209 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 SYCNQ0VAF6 134 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 Q6ZRU5 148 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 SLPIP03973 132 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-201ENST00000312060 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.46□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 C6orf48Q9UBA6 75 aa14.45□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.44□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 Q8N814 137 aa14.44□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 ERG28Q9UKR5 140 aa14.44□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 A0A0U1RRA0 63 aa14.43□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 LINC00587B1AMM8 73 aa14.43□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 TNP2Q05952 138 aa14.43□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 CARD19Q96LW7 228 aa14.43□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 SMIM13P0DJ93 91 aa14.42□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 PFN2P35080 140 aa14.42□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 HIGD1BQ9P298 99 aa14.42□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 TIMM17BO60830 172 aa14.41□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.41□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CTU2-201ENST00000312060 TMEM238C9JI98 176 aa14.4□□□□□ -0.1
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CTU2-201ENST00000312060 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
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CTU2-201ENST00000312060 EREGO14944 169 aa14.39□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 COX17Q14061 63 aa14.39□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.39□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 DDTP30046 118 aa14.39□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 CTAG1AP78358 180 aa14.39□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 RNF151Q2KHN1 245 aa14.38□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.37□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 DAND5Q8N907 189 aa14.37□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa14.37□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.36□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa14.36□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 HIST1H4GQ99525 98 aa14.35□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.34□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 SPANXCQ9NY87 97 aa14.34□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 Q6ZVH6 145 aa14.33□□□□□ -0.11
CTU2-201ENST00000312060 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.33□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.32□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 NPC2P61916 151 aa14.31□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 HSD52Q0P140 79 aa14.31□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 TLX1NBP0CAT3 122 aa14.3□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 TAL2Q16559 108 aa14.3□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 Q6ZRP5 223 aa14.3□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.3□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.3□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.29□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.29□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.28□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa14.28□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 RYR3Q15413 4870 aa14.27□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 IFITM1P13164 125 aa14.27□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 GCSHP23434 173 aa14.27□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 GAGE2EQ4V326 116 aa14.27□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.27□□□□□ -0.12
CTU2-201ENST00000312060 PKD1P98161 4303 aa14.27□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.26□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 PTTG1IPP53801 180 aa14.26□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 CEND1Q8N111 149 aa14.26□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 LINC01620Q4KN68 170 aa14.26□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.26□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 COPS9Q8WXC6 57 aa14.26□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 XAGE1AQ9HD64 81 aa14.25□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 GAGE2BQ13066 116 aa14.24□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.23□□□□□ -0.13
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP10-2P60368 255 aa14.23□□□□□ -0.13
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