RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 COX7CP15954 63 aa6.84□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 MBD6Q96DN6 1003 aa6.84□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 PROK1P58294 105 aa6.84□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 C19orf84I3L1E1 186 aa6.84□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 Q8N814 137 aa6.84□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.84□□□□□ -1.32
CUX1-201ENST00000292535 LIMD2Q9BT23 127 aa6.84□□□□□ -1.32
CUX1-201ENST00000292535 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.83□□□□□ -1.32
CUX1-201ENST00000292535 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.83□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 IGLV2-11P01706 119 aa6.83□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CUX1-201ENST00000292535 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CUX1-201ENST00000292535 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.82□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 C1orf195Q5TG92 126 aa6.82□□□□□ -1.32
CUX1-201ENST00000292535 MSMPQ1L6U9 139 aa6.82□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 X6R8D5 127 aa6.81□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CUX1-201ENST00000292535 ZNF702PQ9H963 129 aa6.81□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.8□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 CNFNQ9BYD5 112 aa6.79□□□□□ -1.32
CUX1-201ENST00000292535 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.79□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.78□□□□□ -1.32
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CUX1-201ENST00000292535 Q8N6K4 173 aa6.77□□□□□ -1.33
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CUX1-201ENST00000292535 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.76□□□□□ -1.33
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CUX1-201ENST00000292535 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.74□□□□□ -1.33
CUX1-201ENST00000292535 A8MZ25 164 aa6.73□□□□□ -1.33
CUX1-201ENST00000292535 IGIPA6NJ69 53 aa6.73□□□□□ -1.33
CUX1-201ENST00000292535 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.73□□□□□ -1.33
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CUX1-201ENST00000292535 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.72□□□□□ -1.33
CUX1-201ENST00000292535 PRR9Q5T870 116 aa6.72□□□□□ -1.33
CUX1-201ENST00000292535 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.72□□□□□ -1.33
CUX1-201ENST00000292535 LINC00208Q96KT6 92 aa6.72□□□□□ -1.33
CUX1-201ENST00000292535 SPINK1P00995 79 aa6.72□□□□□ -1.33
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CUX1-201ENST00000292535 ITPR2Q14571 2701 aa6.72□□□□□ -1.33
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CUX1-201ENST00000292535 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 LINC00575Q6W349 94 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 FLNCQ14315 2725 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZPA2 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 Q8N3U1 123 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 PRM2P04554 102 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 PCSK5Q92824 1860 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 C16orf95Q9H693 158 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 COX6A2Q02221 97 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 WISP2O76076 250 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 FHL2Q14192 279 aa6.68□□□□□ -1.34
CUX1-201ENST00000292535 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.67□□□□□ -1.34
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