RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 Q6ZRU5 148 aa15.3■□□□□ 0.04
RAB20-201ENST00000267328 CXCL5P42830 114 aa15.29■□□□□ 0.04
RAB20-201ENST00000267328 HERVK_113P61574 105 aa15.28■□□□□ 0.04
RAB20-201ENST00000267328 C16orf90A8MZG2 172 aa15.27■□□□□ 0.04
RAB20-201ENST00000267328 GCSHP23434 173 aa15.27■□□□□ 0.04
RAB20-201ENST00000267328 C2orf82Q6UX34 121 aa15.27■□□□□ 0.04
RAB20-201ENST00000267328 CKS1BP61024 79 aa15.27■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 C10orf25Q5T742 122 aa15.27■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.27■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 RNF151Q2KHN1 245 aa15.26■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 LINC01620Q4KN68 170 aa15.25■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 C6orf48Q9UBA6 75 aa15.24■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.23■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 LEPROTO15243 131 aa15.23■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 E9PLD3 99 aa15.22■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 KRTAP10-1P60331 282 aa15.22■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 ATOH7Q8N100 152 aa15.22■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 STPG4Q8N801 248 aa15.22■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 PLEKHB2Q96CS7 222 aa15.22■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 SFTA2Q6UW10 78 aa15.21■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 SDIM1Q6ZPB5 146 aa15.21■□□□□ 0.03
RAB20-201ENST00000267328 SCGB1D1O95968 90 aa15.19■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.19■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 J3QQQ9 107 aa15.18■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 PKIGQ9Y2B9 76 aa15.18■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 TLX1NBP0CAT3 122 aa15.17■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 APOBP04114 4563 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.16■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 NDUFA12Q9UI09 145 aa15.16■□□□□ 0.02
RAB20-201ENST00000267328 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 ANKRD39Q53RE8 183 aa15.14■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.13■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 NMUP48645 174 aa15.13■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 Q6ZSA8 131 aa15.13■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa15.12■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa15.12■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 HERV-K104P63124 156 aa15.12■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 MAJINQ3KP22 176 aa15.12■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 A0A096LNI7 61 aa15.11■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 FAM30AQ9NZY2 134 aa15.11■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 PTTG1IPP53801 180 aa15.1■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 Q6ZRP5 223 aa15.1■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 HSBP1L1C9JCN9 74 aa15.09■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 ERG28Q9UKR5 140 aa15.09■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 CHTF8P0CG12 524 aa15.08■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 PYY3Q5JQD4 70 aa15.08■□□□□ 0.01
RAB20-201ENST00000267328 PANO1I0J062 215 aa15.07■□□□□ 0
RAB20-201ENST00000267328 GAGE2BQ13066 116 aa15.07■□□□□ 0
RAB20-201ENST00000267328 COX17Q14061 63 aa15.07■□□□□ 0
RAB20-201ENST00000267328 BIRC6Q9NR09 4857 aa15.07■□□□□ 0
RAB20-201ENST00000267328 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa15.07■□□□□ 0
RAB20-201ENST00000267328 SPACA4Q8TDM5 124 aa15.07■□□□□ 0
RAB20-201ENST00000267328 LINC00474Q9P2X8 69 aa15.07■□□□□ 0
RAB20-201ENST00000267328 PFN2P35080 140 aa15.04■□□□□ -0
RAB20-201ENST00000267328 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.04■□□□□ -0
RAB20-201ENST00000267328 LINC00587B1AMM8 73 aa15.03■□□□□ -0
RAB20-201ENST00000267328 GAGE2EQ4V326 116 aa15.03■□□□□ -0
RAB20-201ENST00000267328 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.03■□□□□ -0
RAB20-201ENST00000267328 GAGE2DQ9UEU5 116 aa15.03■□□□□ -0
RAB20-201ENST00000267328 ZNF815PA8K554 130 aa15.02■□□□□ -0
RAB20-201ENST00000267328 A0A0J9YXY3 114 aa15.01□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 SMIM13P0DJ93 91 aa15.01□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 PCP2Q8IVA1 136 aa15.01□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 CDK2AP2O75956 126 aa15□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 XGP55808 180 aa15□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 LINC00158P58513 81 aa15□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 HSPG2P98160 4391 aa14.99□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 SCXQ7RTU7 201 aa14.99□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 VAMP8Q9BV40 100 aa14.99□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 RYR1P21817 5038 aa14.98□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 A0A087WYN8 130 aa14.97□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 A0A0U1RRA0 63 aa14.97□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.97□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 XAGE1AQ9HD64 81 aa14.97□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.97□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 DPH3Q96FX2 82 aa14.97□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 PLAC8Q9NZF1 115 aa14.97□□□□□ -0.01
RAB20-201ENST00000267328 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.96□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 SPATA45Q537H7 98 aa14.96□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa14.96□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.96□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 EPM2AB3EWF7 344 aa14.95□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 HAMPP81172 84 aa14.95□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa14.95□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 A0A1W2PNN7 141 aa14.94□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 TIMM17BO60830 172 aa14.94□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 COX8AP10176 69 aa14.92□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 LITAFQ99732 161 aa14.92□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.92□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 FAM168BA1KXE4 195 aa14.91□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.91□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.9□□□□□ -0.02
RAB20-201ENST00000267328 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.3 ms