RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 MED12LQ86YW9 2145 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF702PQ9H963 129 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC01006Q8NI28 216 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 HCFC1P51610 2035 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 PRR9Q5T870 116 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A087WYN8 130 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 PROK1P58294 105 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 PRR4Q16378 134 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 CACNA1EQ15878 2313 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 MSMPQ1L6U9 139 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 C1orf137Q5JT78 98 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 SDK2Q58EX2 2172 aa7.16□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.15□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
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SPTAN1-228ENST00000635853 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZQY7 126 aa7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 REG3GQ6UW15 175 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 SPINK1P00995 79 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 FHL2Q14192 279 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 AMELXQ99217 191 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 SMR3AQ99954 134 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 ACACAQ13085 2346 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 COX17Q14061 63 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 EDN2P20800 178 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF580Q9UK33 172 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 NOTCH4Q99466 2003 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8N814 137 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 CEP250Q9BV73 2442 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 PSPHP1O15172 72 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8N3U1 123 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 CXCL6P80162 114 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 C6orf223Q8N319 242 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 KLLNB2CW77 178 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 LIMD2Q9BT23 127 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 AKAP6Q13023 2319 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 CD164Q04900 197 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-228ENST00000635853 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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SPTAN1-228ENST00000635853 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 PTPRSQ13332 1948 aa7.09□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 DYSFO75923 2080 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 DOCK7Q96N67 2140 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.07□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 COL4A2P08572 1712 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8N6K4 173 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 C2orf48Q96LS8 159 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 NACAE9PAV3 2078 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 NCOR1O75376 2440 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8IZM0 81 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC01600Q96MT4 127 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 Q9BRP9 147 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 CELA1Q9UNI1 258 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 COX6A2Q02221 97 aa7.05□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.05□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 PRM2P04554 102 aa7.05□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.05□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 LRP4O75096 1905 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 MUC7Q8TAX7 377 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 POLEQ07864 2286 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 LTBP2Q14767 1821 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 PCOTHQ58A44 107 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00208Q96KT6 92 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZTC4 211 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.03□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.03□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 CADP27708 2225 aa7.03□□□□□ -1.28
SPTAN1-228ENST00000635853 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 LITAFQ99732 161 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 Q5XG85 94 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8N2B8 174 aa7.01□□□□□ -1.29
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