RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A34Q6PIV7 304 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DDTP30046 118 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 BOD1L2Q8IYS8 172 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAH7Q8WXX0 4024 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ENHOQ6UWT2 76 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 TP73-AS1Q9UF72 201 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SPINK8P0C7L1 97 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 TTTY13Q9BZ97 58 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 LEPROTO15243 131 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SIVA1O15304 175 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DLEU1O43261 78 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CSMD3Q7Z407 3707 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 XCL1P47992 114 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPEAR-AS2P59090 65 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM1B2RUZ4 78 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 J3QQQ9 107 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 CRPP02741 224 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2WQ96B02 151 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHB2Q96CS7 222 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 CD164L2Q6UWJ8 174 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WZ39 114 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 MIAQ16674 131 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf38Q86SI9 138 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 Q9H8V8 135 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-215ENST00000628018 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFAND6Q6FIF0 208 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf91Q6ZV80 131 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC01561Q8N1V8 128 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC7Q8TAX7 377 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF815PA8K554 130 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00587B1AMM8 73 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXI1Q12951 378 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 GAGE12HA6NDE8 117 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 COX7A2LO14548 114 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf126Q8N4M7 172 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 STARD9Q9P2P6 4700 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAG1AP78358 180 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 HIGD1BQ9P298 99 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 K7EP13 123 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFA12Q9UI09 145 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TGP01266 2768 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 COX7B2Q8TF08 81 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf43Q9BWL3 253 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFA1O15239 70 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 MALP21145 153 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SCGB1D4Q6XE38 83 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TOMM7Q9P0U1 55 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 LYSTQ99698 3801 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 Q9HAA7 133 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TENM2Q9NT68 2774 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0J9YXY3 114 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 Q8IZM0 81 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 APOMO95445 188 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ORAOV1Q8WV07 137 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAH1Q9P2D7 4330 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0087Q14695 138 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf226Q5I0X4 101 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS2P07478 247 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RMI2Q96E14 147 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 HERV-K104P63124 156 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 HSD52Q0P140 79 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CASC10Q5T4H9 136 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS13DQ5THJ4 4388 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TAL2Q16559 108 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SFTA2Q6UW10 78 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SNHG12Q9BXW3 62 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R143 59 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SPAG11BQ08648 103 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC32Q5I0X7 151 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 LITAFQ99732 161 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf84H3BNL1 204 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP161Q6P656 301 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 HIST1H4GQ99525 98 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM238C9JI98 176 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 TIMM17BO60830 172 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL5P42830 114 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 C15orf56Q8N910 161 aa16.51■□□□□ 0.23
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