RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621271.4

CLTCL1-211, Transcript of clathrin heavy chain like 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTCL1, Length 5,313 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1-211ENST00000621271 RNF185Q96GF1 192 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTCL1-211ENST00000621271 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTCL1-211ENST00000621271 SVIPQ8NHG7 77 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTCL1-211ENST00000621271 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTCL1-211ENST00000621271 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTCL1-211ENST00000621271 M0R378 163 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTCL1-211ENST00000621271 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTCL1-211ENST00000621271 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTCL1-211ENST00000621271 UTRNP46939 3433 aa7.16□□□□□ -1.26
CLTCL1-211ENST00000621271 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.15□□□□□ -1.26
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CLTCL1-211ENST00000621271 USP17L23D6RBM5 183 aa7.15□□□□□ -1.26
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CLTCL1-211ENST00000621271 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLTCL1-211ENST00000621271 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTCL1-211ENST00000621271 UQCRQO14949 82 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTCL1-211ENST00000621271 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTCL1-211ENST00000621271 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTCL1-211ENST00000621271 TMEM223A0PJW6 202 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTCL1-211ENST00000621271 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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CLTCL1-211ENST00000621271 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.12□□□□□ -1.27
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CLTCL1-211ENST00000621271 CCKP06307 115 aa7.11□□□□□ -1.27
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CLTCL1-211ENST00000621271 TSHBP01222 138 aa7.1□□□□□ -1.27
CLTCL1-211ENST00000621271 PRR9Q5T870 116 aa7.1□□□□□ -1.27
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CLTCL1-211ENST00000621271 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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CLTCL1-211ENST00000621271 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.06□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 C10orf25Q5T742 122 aa7.06□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 GAS8-AS1O95177 125 aa7.06□□□□□ -1.28
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CLTCL1-211ENST00000621271 SCXQ7RTU7 201 aa7.06□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.06□□□□□ -1.28
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CLTCL1-211ENST00000621271 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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CLTCL1-211ENST00000621271 CCDC179H3BU77 68 aa7.04□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 LST1O00453 97 aa7.04□□□□□ -1.28
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CLTCL1-211ENST00000621271 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.04□□□□□ -1.28
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CLTCL1-211ENST00000621271 FHL2Q14192 279 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 Q6Q795 121 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 REG3GQ6UW15 175 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 C20orf197Q8N268 126 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 MDFIQ99750 246 aa7.03□□□□□ -1.28
CLTCL1-211ENST00000621271 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CLTCL1-211ENST00000621271 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.02□□□□□ -1.29
CLTCL1-211ENST00000621271 EML5Q05BV3 1969 aa7.02□□□□□ -1.29
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