RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 XCL1P47992 114 aa13.91□□□□□ -0.18
CSAG3-202ENST00000617158 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.9□□□□□ -0.18
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa13.9□□□□□ -0.18
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa13.9□□□□□ -0.18
CSAG3-202ENST00000617158 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.9□□□□□ -0.18
CSAG3-202ENST00000617158 F8VRH5 84 aa13.9□□□□□ -0.18
CSAG3-202ENST00000617158 NFE4Q86UQ8 179 aa13.9□□□□□ -0.18
CSAG3-202ENST00000617158 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13.89□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.89□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa13.88□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 CD164L2Q6UWJ8 174 aa13.88□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 DNAH2Q9P225 4427 aa13.88□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 C6orf223Q8N319 242 aa13.87□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa13.87□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa13.86□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 CHAC1Q9BUX1 264 aa13.86□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 C5orf38Q86SI9 138 aa13.85□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 HERVK_113P63121 156 aa13.84□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 RMI2Q96E14 147 aa13.84□□□□□ -0.19
CSAG3-202ENST00000617158 RTL8CO15255 209 aa13.83□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 DPM2O94777 84 aa13.83□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 SEC11AP67812 179 aa13.83□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 WFDC2Q14508 124 aa13.83□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf134Q5TEV5 83 aa13.83□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 A0A087WZ39 114 aa13.82□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 IGKCP01834 107 aa13.81□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00469Q8N7U9 141 aa13.81□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 TM2D2Q9BX73 214 aa13.81□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.8□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.8□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 COX7A2LO14548 114 aa13.8□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 PLNP26678 52 aa13.8□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 C15orf56Q8N910 161 aa13.8□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 ATOH7Q8N100 152 aa13.79□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 COX11Q9Y6N1 276 aa13.79□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.78□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 PYY3Q5JQD4 70 aa13.78□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.78□□□□□ -0.2
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM223A0PJW6 202 aa13.77□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 C20orf202A1L168 122 aa13.77□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 SPINK8P0C7L1 97 aa13.77□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 FRAS1Q86XX4 4008 aa13.77□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 LINC01561Q8N1V8 128 aa13.77□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L23D6RBM5 183 aa13.76□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 LECT2O14960 151 aa13.76□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 SCGB1D1O95968 90 aa13.76□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13.75□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa13.75□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 AKR1D1P51857 326 aa13.75□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.75□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 STPG4Q8N801 248 aa13.75□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 PSCAO43653 123 aa13.74□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 MAJINQ3KP22 176 aa13.74□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 RYR3Q15413 4870 aa13.73□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa13.73□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 TNP2Q05952 138 aa13.73□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA0087Q14695 138 aa13.73□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 hDV102S1A0JD36 115 aa13.72□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 H3BRM9 83 aa13.72□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 MALP21145 153 aa13.71□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 HIGD2BQ4VC39 106 aa13.71□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.71□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 ORAOV1Q8WV07 137 aa13.71□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00526Q96FQ7 95 aa13.71□□□□□ -0.21
CSAG3-202ENST00000617158 A0A087WTM6 91 aa13.7□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 TSPEAR-AS2P59090 65 aa13.7□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.69□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 SLPIP03973 132 aa13.68□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 FAT2Q9NYQ8 4349 aa13.67□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 APOMO95445 188 aa13.67□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 SPAG11BQ08648 103 aa13.67□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 CFAP161Q6P656 301 aa13.67□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 E9PLD3 99 aa13.66□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 COX7B2Q8TF08 81 aa13.66□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 DNAH11Q96DT5 4516 aa13.66□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 LEPROTO15243 131 aa13.65□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 Q8IZM0 81 aa13.65□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 TOMM7Q9P0U1 55 aa13.65□□□□□ -0.22
CSAG3-202ENST00000617158 C2orf82Q6UX34 121 aa13.64□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 Q8N814 137 aa13.64□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 C10orf25Q5T742 122 aa13.63□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 HERVK_113P61574 105 aa13.62□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.62□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP13.61□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.61□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 J3QQQ9 107 aa13.6□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.6□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 C2orf48Q96LS8 159 aa13.6□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa13.59□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 C14orf177Q52M58 125 aa13.59□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.59□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 Q6ZRU5 148 aa13.59□□□□□ -0.23
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CSAG3-202ENST00000617158 PRSS2P07478 247 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms