RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	GAS8-AS1	O95177	125 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	COX6A2	Q02221	97 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	C20orf78	Q9BR46	151 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A087WYN8	130 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	S100A2	P29034	98 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXI1	Q12951	378 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAJIN	Q3KP22	176 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	COX7A2L	O14548	114 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	APOM	O95445	188 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPBP	P02775	128 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLPI	P03973	132 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHTF8	P0CG12	524 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMIM6	P0DI80	62 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	NRAC	Q8N912	160 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	CARD19	Q96LW7	228 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		7	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	PANO1	I0J062	215 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYCN	Q0VAF6	134 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	IFITM10	A6NMD0	228 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	TNFRSF6B	O95407	300 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	LCE2C	Q5TA81	110 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	STPG4	Q8N801	248 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197		D6R8Y8	96 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	FABP4	P15090	132 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	BAGE3	Q86Y29	109 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	ORMDL3	Q8N138	153 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERF1A	O75920	110 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q6ZRU5	148 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q6ZUT4	128 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRELID3A	Q96N28	172 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	C12orf57	Q99622	126 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A096LNI7	61 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPY	P01303	97 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	LINC00310	P59036	64 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	GAGE2B	Q13066	116 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	C5orf38	Q86SI9	138 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPAG11B	Q08648	103 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	C2orf48	Q96LS8	159 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q6ZN92	141 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197		F8WDY8	70 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	NUPR1	O60356	82 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTTG1IP	P53801	180 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYCBP2	O75592	4640 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		6.9	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	NDUFA1	O15239	70 aa		6.9	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSBP1	O75506	76 aa		6.9	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	G0S2	P27469	103 aa		6.9	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	PYY3	Q5JQD4	70 aa		6.9	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
NPIPB4-222	ENST00000614197	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF151	Q2KHN1	245 aa		6.89	□□□□□ -1.31
NPIPB4-222	ENST00000614197	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		6.89	□□□□□ -1.31

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