RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 COX17Q14061 63 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 BRI3O95415 125 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.65□□□□□ -0.06
CTDP1-208ENST00000613122 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 Q8IZM0 81 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZQY7 126 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 C3orf84H3BNL1 204 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 SDIM1Q6ZPB5 146 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 MUC7Q8TAX7 377 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZTC4 211 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 ENHOQ6UWT2 76 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 G3V4G9 280 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF580Q9UK33 172 aa14.58□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 M0QXV9 152 aa14.57□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 RPL28P46779 137 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 PTPRSQ13332 1948 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 SMIM11BQ8TCY0 68 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 GAS8-AS1O95177 125 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.56□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 CNFNQ9BYD5 112 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 J3KT08 172 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFC2O95298 119 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.55□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 FHL2Q14192 279 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 PLXNB1O43157 2135 aa14.53□□□□□ -0.08
CTDP1-208ENST00000613122 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.52□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 C20orf197Q8N268 126 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 C10orf25Q5T742 122 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 C6orf223Q8N319 242 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 WFDC13Q8IUB5 93 aa14.51□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.5□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 HCFC1P51610 2035 aa14.49□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 IGIPA6NJ69 53 aa14.48□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 REG3GQ6UW15 175 aa14.47□□□□□ -0.09
CTDP1-208ENST00000613122 YPEL4Q96NS1 127 aa14.46□□□□□ -0.09
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CTDP1-208ENST00000613122 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 K7ERS5 55 aa14.44□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 FSHBP01225 129 aa14.44□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.43□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.43□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.43□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 MT-ATP8P03928 68 aa14.42□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00694P0DN24 101 aa14.42□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.41□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa14.41□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 COX6A2Q02221 97 aa14.4□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.4□□□□□ -0.1
CTDP1-208ENST00000613122 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.4□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 UQCRQO14949 82 aa14.39□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 F8WDY8 70 aa14.39□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf137Q5JT78 98 aa14.39□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa14.38□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 FAM236CP0DP71 79 aa14.38□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.38□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.38□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 PRR15LQ9BU68 103 aa14.38□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 FHL3Q13643 280 aa14.37□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 Q8N9L7 120 aa14.36□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.35□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 ADAMTS20P59510 1910 aa14.34□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1B0GUV1 79 aa14.34□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 C2orf48Q96LS8 159 aa14.34□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 MPLKIPQ8TAP9 179 aa14.33□□□□□ -0.11
CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZSN1 163 aa14.33□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 Q8N2B8 174 aa14.33□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.33□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.32□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 SPTSSBQ8NFR3 76 aa14.32□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 SVIPQ8NHG7 77 aa14.31□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 SERP1Q9Y6X1 66 aa14.31□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 BRK1Q8WUW1 75 aa14.31□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
CTDP1-208ENST00000613122 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
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