RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606213.5

PTPRN-219, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRN-219ENST00000606213 SEC11AP67812 179 aa14.74□□□□□ -0.05
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PTPRN-219ENST00000606213 ERASQ7Z444 233 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-219ENST00000606213 SVBPQ8N300 66 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-219ENST00000606213 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-219ENST00000606213 PRSS2P07478 247 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-219ENST00000606213 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-219ENST00000606213 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.71□□□□□ -0.05
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PTPRN-219ENST00000606213 LINC01546A6NGU7 62 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN-219ENST00000606213 GAGE2EQ4V326 116 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN-219ENST00000606213 Q6ZRP5 223 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN-219ENST00000606213 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN-219ENST00000606213 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN-219ENST00000606213 TLX1NBP0CAT3 122 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-219ENST00000606213 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-219ENST00000606213 Q8IZM0 81 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN-219ENST00000606213 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.59□□□□□ -0.07
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