RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591315.5

VMP1-211, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene VMP1, Length 800 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-211ENST00000591315 IFITM10A6NMD0 228 aa7.39□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 CHTF8P0CG12 524 aa7.39□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 Q5VSD8 79 aa7.39□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.39□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.39□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.39□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.39□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.39□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.38□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 IGIPA6NJ69 53 aa7.38□□□□□ -1.23
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VMP1-211ENST00000591315 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.38□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.38□□□□□ -1.23
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VMP1-211ENST00000591315 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.38□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 EPM2AB3EWF7 344 aa7.37□□□□□ -1.23
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VMP1-211ENST00000591315 TMEM141Q96I45 108 aa7.37□□□□□ -1.23
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VMP1-211ENST00000591315 MALP21145 153 aa7.36□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.36□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.35□□□□□ -1.23
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VMP1-211ENST00000591315 UBE2D1P51668 147 aa7.35□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.35□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 TOMM6Q96B49 74 aa7.35□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 AMELXQ99217 191 aa7.35□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 MYCBP2O75592 4640 aa7.34□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 K7EMI3 77 aa7.34□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.34□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 Q6ZRU5 148 aa7.34□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 FA2HQ7L5A8 372 aa7.34□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 VCX2Q9H322 139 aa7.34□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.34□□□□□ -1.23
VMP1-211ENST00000591315 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.33□□□□□ -1.24
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VMP1-211ENST00000591315 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.33□□□□□ -1.24
VMP1-211ENST00000591315 SYCNQ0VAF6 134 aa7.33□□□□□ -1.24
VMP1-211ENST00000591315 CARD19Q96LW7 228 aa7.33□□□□□ -1.24
VMP1-211ENST00000591315 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.33□□□□□ -1.24
VMP1-211ENST00000591315 A0A096LNI7 61 aa7.32□□□□□ -1.24
VMP1-211ENST00000591315 A0A096LNJ9 63 aa7.32□□□□□ -1.24
VMP1-211ENST00000591315 FAM229AH3BQW9 127 aa7.32□□□□□ -1.24
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VMP1-211ENST00000591315 C10orf25Q5T742 122 aa7.32□□□□□ -1.24
VMP1-211ENST00000591315 Q6ZN92 141 aa7.32□□□□□ -1.24
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VMP1-211ENST00000591315 LINC00614P0C842 121 aa7.29□□□□□ -1.24
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VMP1-211ENST00000591315 C2orf48Q96LS8 159 aa7.29□□□□□ -1.24
VMP1-211ENST00000591315 NPSP0C0P6 89 aa7.28□□□□□ -1.24
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VMP1-211ENST00000591315 C2orf82Q6UX34 121 aa7.28□□□□□ -1.24
VMP1-211ENST00000591315 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.28□□□□□ -1.24
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VMP1-211ENST00000591315 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.27□□□□□ -1.25
VMP1-211ENST00000591315 HBDP02042 147 aa7.26□□□□□ -1.25
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VMP1-211ENST00000591315 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.26□□□□□ -1.25
VMP1-211ENST00000591315 STPG4Q8N801 248 aa7.26□□□□□ -1.25
VMP1-211ENST00000591315 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.26□□□□□ -1.25
VMP1-211ENST00000591315 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
VMP1-211ENST00000591315 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-211ENST00000591315 NDUFA1O15239 70 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-211ENST00000591315 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VMP1-211ENST00000591315 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VMP1-211ENST00000591315 PTTG1IPP53801 180 aa7.25□□□□□ -1.25
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