RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.64□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.64□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 COX6A2Q02221 97 aa7.63□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 DPH3Q96FX2 82 aa7.63□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.63□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 LINC01546A6NGU7 62 aa7.62□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 K7EMI3 77 aa7.62□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 TCAPO15273 167 aa7.62□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 ESDP10768 282 aa7.62□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 FCER1GP30273 86 aa7.62□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 ODF1Q14990 250 aa7.62□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 RNF213Q63HN8 5207 aa7.61□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.61□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 LINC00614P0C842 121 aa7.61□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 RAB5BP61020 215 aa7.61□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 FA2HQ7L5A8 372 aa7.61□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 BAGE3Q86Y29 109 aa7.61□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 MAJINQ3KP22 176 aa7.6□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.6□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 A0A096LNI7 61 aa7.59□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 LINC00310P59036 64 aa7.59□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 FOXI1Q12951 378 aa7.59□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 CFAP161Q6P656 301 aa7.59□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 C7orf33Q8WU49 177 aa7.59□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTIF-208ENST00000590422 SERF1AO75920 110 aa7.58□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 FGF6P10767 208 aa7.58□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.58□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 STPG4Q8N801 248 aa7.58□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 H7C423 109 aa7.57□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 NUPR1O60356 82 aa7.57□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.57□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 A0A096LNJ9 63 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 G0S2P27469 103 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 XCL1P47992 114 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 NDUFA6P56556 154 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 TMEM18Q96B42 140 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 LINC01600Q96MT4 127 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.56□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 HSBP1O75506 76 aa7.55□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 PMCHL1Q16048 86 aa7.55□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.55□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 TOMM6Q96B49 74 aa7.55□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.55□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.54□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 CCL25O15444 150 aa7.54□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 HBDP02042 147 aa7.54□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.54□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.54□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.54□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.54□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 LINC01549A6NIU2 74 aa7.53□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 IGIPA6NJ69 53 aa7.53□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.53□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.53□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTIF-208ENST00000590422 ERASQ7Z444 233 aa7.52□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 FAM104AQ969W3 186 aa7.52□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 TMEM101Q96IK0 257 aa7.52□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 CARD19Q96LW7 228 aa7.52□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.52□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.51□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 A0A0J9YXV3 536 aa7.51□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 S100A6P06703 90 aa7.51□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 TIMM17AQ99595 171 aa7.51□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.51□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.5□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 NPSP0C0P6 89 aa7.5□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZUT4 128 aa7.5□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.5□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 TMEM141Q96I45 108 aa7.5□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 C5orf52A6NGY3 159 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 ATP5LO75964 103 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 LEPROTL1O95214 131 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 KRTAP10-8P60410 259 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 SYCNQ0VAF6 134 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 FABP4P15090 132 aa7.48□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 PTTG1IPP53801 180 aa7.48□□□□□ -1.21
CTIF-208ENST00000590422 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
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