RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 AMELXQ99217 191 aa4.03□□□□□ -1.76
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMM17AQ99595 171 aa4.03□□□□□ -1.76
CAPNS1-208ENST00000589162 VCX2Q9H322 139 aa4.03□□□□□ -1.76
CAPNS1-208ENST00000589162 CST9LQ9H4G1 147 aa4.03□□□□□ -1.76
CAPNS1-208ENST00000589162 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.03□□□□□ -1.76
CAPNS1-208ENST00000589162 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CAPNS1-208ENST00000589162 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 LCE6AA0A183 80 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GUV1 79 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf86A6NJI1 115 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 LECT2O14960 151 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 CRPP02741 224 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2D1P51668 147 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 AKR1D1P51857 326 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 WFDC2Q14508 124 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PMVKQ15126 192 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 C5orf38Q86SI9 138 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR34Q9NV39 138 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 MAJINQ3KP22 176 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZR54 194 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TGP01266 2768 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 hDV102S1A0JD36 115 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 SPINK8P0C7L1 97 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 G0S2P27469 103 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PKIAP61925 76 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXI1Q12951 378 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 SS18Q15532 418 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf88Q9BSF0 95 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 F8VRH5 84 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 SCGB1D1O95968 90 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLC3P0DOY3 106 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01545Q5VT33 79 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PET117Q6UWS5 81 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 STPG4Q8N801 248 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf43Q9BWL3 253 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 RYR3Q15413 4870 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 RTL8CO15255 209 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 DPM2O94777 84 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 MIAQ16674 131 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC32Q5I0X7 151 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PYY3Q5JQD4 70 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 NFE4Q86UQ8 179 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf223Q8N319 242 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01549A6NIU2 74 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L23D6RBM5 183 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PSCAO43653 123 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKCP01834 107 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 NPSP0C0P6 89 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 C15orf56Q8N910 161 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-208ENST00000589162 TENM2Q9NT68 2774 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
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