RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		14.11	□□□□□ -0.15
GPS1-222	ENST00000583983	YPEL4	Q96NS1	127 aa		14.11	□□□□□ -0.15
GPS1-222	ENST00000583983	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GPS1-222	ENST00000583983	NPS	P0C0P6	89 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GPS1-222	ENST00000583983	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GPS1-222	ENST00000583983	TOMM6	Q96B49	74 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GPS1-222	ENST00000583983	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
GPS1-222	ENST00000583983	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		14.1	□□□□□ -0.15
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		14.09	□□□□□ -0.15
GPS1-222	ENST00000583983	FAM229A	H3BQW9	127 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	PANO1	I0J062	215 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983		Q6ZN92	141 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	AMELX	Q99217	191 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	VCX2	Q9H322	139 aa		14.08	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	APOM	O95445	188 aa		14.07	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		14.07	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	TIMM17A	Q99595	171 aa		14.07	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		14.07	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		14.06	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	UBE2D1	P51668	147 aa		14.06	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	14.06	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	FA2H	Q7L5A8	372 aa		14.06	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	COX6A2	Q02221	97 aa		14.05	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		14.05	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		14.05	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	CARD19	Q96LW7	228 aa		14.05	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	SYCN	Q0VAF6	134 aa		14.04	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		14.04	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	ERAS	Q7Z444	233 aa		14.04	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		14.04	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		14.04	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		14.04	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	LINC01549	A6NIU2	74 aa		14.03	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	CHTF8	P0CG12	524 aa		14.03	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		14.03	□□□□□ -0.16
GPS1-222	ENST00000583983		A0A087WZ39	114 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	SPAG11B	Q08648	103 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	C2orf48	Q96LS8	159 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983		Q6ZRU5	148 aa		14	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		14	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		14	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	DPH3	Q96FX2	82 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	LINC00614	P0C842	121 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983		A0A087WYN8	130 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983		A0A096LNI7	61 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983		A0A096LNJ9	63 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GPS1-222	ENST00000583983		F8WDY8	70 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	SEC11A	P67812	179 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	MAJIN	Q3KP22	176 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	RAB5B	P61020	215 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	HERVK_113	P63121	156 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	KIAA0087	Q14695	138 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983		A0A0J9YXV3	536 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	RNF151	Q2KHN1	245 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	CST9L	Q9H4G1	147 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	NDUFA1	O15239	70 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	HBD	P02042	147 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	PMVK	Q15126	192 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	PMCHL1	Q16048	86 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	C10orf25	Q5T742	122 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	PTTG1IP	P53801	180 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GPS1-222	ENST00000583983	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	STPG4	Q8N801	248 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	TRGC2	P03986	189 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	GAGE2B	Q13066	116 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	COLCA2	A8K830	154 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	C2orf82	Q6UX34	121 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	ATP5L	O75964	103 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	PRSS2	P07478	247 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983		Q8IZM0	81 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GPS1-222	ENST00000583983	NDUFA6	P56556	154 aa		13.83	□□□□□ -0.2

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