RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 PYYP10082 97 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 FGF7P21781 194 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 TGFBR1P36897 503 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2D1P51668 147 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 RAB4BP61018 213 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2D3P61077 147 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2D2P62837 147 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R1AQ13522 171 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 FXYD5Q96DB9 178 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 MED28Q9H204 178 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 C9orf170A2RU37 121 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 MT-ND6P03923 174 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 NCS1P62166 190 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 CTAG1AP78358 180 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 COX6A2Q02221 97 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 ZFP82Q8N141 532 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 SFRP2Q96HF1 295 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 HYLS1Q96M11 299 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 CST7O76096 145 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV7-43P04211 117 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 PET100P0DJ07 73 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 SULT1A2P50226 295 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 DNLZQ5SXM8 178 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 FAM74A4Q5TZK3 123 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 C5orf17Q8NAS9 161 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2L6O14933 153 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM17P0DL12 118 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 RBX1P62877 108 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 IQCJQ1A5X6 159 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 MIR17HGQ75NE6 70 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 GATD1Q8NB37 220 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 FAM210AQ96ND0 272 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-208ENST00000578600 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 A8MUU9 505 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 B4DEV8 164 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFB6O95139 128 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 FGF6P10767 208 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 S100A5P33763 92 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRM-208ENST00000578600 COTL1Q14019 142 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 PYDC2Q56P42 97 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 AQP10Q96PS8 301 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 DERL1Q9BUN8 251 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 MUC2Q02817 5179 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRM-208ENST00000578600 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 F6UZH7 168 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 K7ERS5 55 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 TCRAP04437 139 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2G2P60604 165 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
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PTPRM-208ENST00000578600 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 FAM24AA6NFZ4 105 aa3□□□□□ -1.93
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PTPRM-208ENST00000578600 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF56Q15929 161 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf137Q5JT78 98 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 FAM162BQ5T6X4 162 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 TRIQKQ629K1 86 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 CARD19Q96LW7 228 aa3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1B0GVG6 124 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 H3BVH4 76 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 M0R381 172 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRM-208ENST00000578600 CXCL1P09341 107 aa2.99□□□□□ -1.93
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