RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 MALP21145 153 aa21.59■■□□□ 1.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf38Q86SI9 138 aa21.58■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa21.57■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIGD2BQ4VC39 106 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERF1AO75920 110 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5LO75964 103 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC11AP67812 179 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00310P59036 64 aa21.54■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PMVKQ15126 192 aa21.54■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 APOMO95445 188 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H2BJP06899 126 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H2BOP23527 126 aa21.53■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H2BDP58876 126 aa21.53■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H2BNQ99877 126 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIST1H2BMQ99879 126 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 CST9LQ9H4G1 147 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP10-1P60331 282 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRP1BQ9NZR2 4599 aa21.52■■□□□ 1.04
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM19A2Q8N3H0 131 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 HERVK_113P63121 156 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLPIP03973 132 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf163Q8N9P6 203 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0J9YXV3 536 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01620Q4KN68 170 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA6P56556 154 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10D4PQ8NGN7 298 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa21.45■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01561Q8N1V8 128 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFI27L1Q96BM0 104 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00526Q96FQ7 95 aa21.44■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK2AP2O75956 126 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPAG11BQ08648 103 aa21.41■■□□□ 1.02
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00469Q8N7U9 141 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZSA8 131 aa21.34■■□□□ 1.01
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1109Q2LD37 5005 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPB8Q9UJY1 196 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDIM1Q6ZPB5 146 aa21.33■■□□□ 1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0087Q14695 138 aa21.3■■□□□ 1
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZRU5 148 aa21.3■■□□□ 1
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA1O15239 70 aa21.27■■□□□ 1
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKIGQ9Y2B9 76 aa21.24■□□□□ 0.99
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SPINK8P0C7L1 97 aa21.23■□□□□ 0.99
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH8Q96JB1 4490 aa21.2■□□□□ 0.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM170BQ5T4T1 132 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 CKS1BP61024 79 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAMPP81172 84 aa21.19■□□□□ 0.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf25Q5T742 122 aa21.19■□□□□ 0.98
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