RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 MT1HL1P0DM35 61 aa10.38□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 LINC01600Q96MT4 127 aa10.38□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10.37□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.37□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa10.36□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 A0A1B0GXF2 115 aa10.36□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 IFITM10A6NMD0 228 aa10.36□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 NDUFA1O15239 70 aa10.36□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.36□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 RAB14P61106 215 aa10.35□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 PRELID3AQ96N28 172 aa10.35□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa10.34□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SPNS1-211ENST00000568829 NPYP01303 97 aa10.34□□□□□ -0.75
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SPNS1-211ENST00000568829 MT-ND6P03923 174 aa10.33□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 ANAPC16Q96DE5 110 aa10.33□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 C2orf88Q9BSF0 95 aa10.33□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 A0A0J9YXV3 536 aa10.32□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 Q6ZN92 141 aa10.32□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 MAP1LC3AQ9H492 121 aa10.32□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 G0S2P27469 103 aa10.31□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 TEX43Q6ZNM6 134 aa10.31□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM141Q96I45 108 aa10.31□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 PRSS47A8MTI9 375 aa10.3□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 K7EMI3 77 aa10.3□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 ORMDL2Q53FV1 153 aa10.3□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 A0A087WZ39 114 aa10.29□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 A0A1W2PNN7 141 aa10.29□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.29□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 CYSLTR1Q9Y271 337 aa10.29□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 NPSP0C0P6 89 aa10.28□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa10.28□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 LINC01561Q8N1V8 128 aa10.28□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
SPNS1-211ENST00000568829 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.27□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa10.27□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 VCX2Q9H322 139 aa10.27□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa10.26□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 C1orf137Q5JT78 98 aa10.26□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 Q8N8P6 123 aa10.26□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.26□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 PRSS2P07478 247 aa10.25□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 SEC11AP67812 179 aa10.25□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.25□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 C2orf66Q6UXQ4 117 aa10.25□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 FAM104AQ969W3 186 aa10.25□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
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SPNS1-211ENST00000568829 CTDSP1Q9GZU7 261 aa10.24□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 KRTAP10-8P60410 259 aa10.23□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 GAGE2EQ4V326 116 aa10.23□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.23□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.23□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 UBR4Q5T4S7 5183 aa10.23□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 TNXBP22105 4242 aa10.23□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa10.22□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 UBE2D1P51668 147 aa10.22□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 CKS1BP61024 79 aa10.22□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 C10orf25Q5T742 122 aa10.21□□□□□ -0.77
SPNS1-211ENST00000568829 LINC01549A6NIU2 74 aa10.2□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 HERVK_113P63121 156 aa10.2□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 UBE2BP63146 152 aa10.2□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA0087Q14695 138 aa10.2□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.2□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
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SPNS1-211ENST00000568829 M0QXV9 152 aa10.18□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 IFITM2Q01629 132 aa10.17□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 UQCC3Q6UW78 93 aa10.17□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.17□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 Q8IZM0 81 aa10.17□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 TIMM17AQ99595 171 aa10.17□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 TOMM7Q9P0U1 55 aa10.17□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 FAM168BA1KXE4 195 aa10.16□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 IGIPA6NJ69 53 aa10.16□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 S100PP25815 95 aa10.16□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 CLLU1Q5K131 121 aa10.16□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 C2orf82Q6UX34 121 aa10.16□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 CXCL5P42830 114 aa10.15□□□□□ -0.78
SPNS1-211ENST00000568829 H0Y9J4 135 aa10.14□□□□□ -0.79
SPNS1-211ENST00000568829 ODF1Q14990 250 aa10.14□□□□□ -0.79
SPNS1-211ENST00000568829 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SPNS1-211ENST00000568829 TOMM6Q96B49 74 aa10.14□□□□□ -0.79
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