RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567491.1

SH3RF3-AS1-201, SH3RF3 antisense RNA 1, humanhuman

BASIC

Gene SH3RF3-AS1, Length 1,604 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RTL8CO15255 209 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 COX6A2Q02221 97 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C3orf79P0CE67 100 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.77□□□□□ -0.04
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 HERVK_113P63121 156 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ODF1Q14990 250 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CHAC1Q9BUX1 264 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 F8VRH5 84 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 COX7A2LO14548 114 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C5orf38Q86SI9 138 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DNAH2Q9P225 4427 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGLC3P0DOY3 106 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LECT2O14960 151 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 MALP21145 153 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C11orf86A6NJI1 115 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PET117Q6UWS5 81 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 USP17L23D6RBM5 183 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TNP2Q05952 138 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 WFDC2Q14508 124 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 A0A087WZ39 114 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.7□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 RYR3Q15413 4870 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DPM2O94777 84 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PLNP26678 52 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LINC01545Q5VT33 79 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 OR10D4PQ8NGN7 298 aa14.69□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C20orf202A1L168 122 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CFAP161Q6P656 301 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 A0A087WTM6 91 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 H3BRM9 83 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 APOMO95445 188 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C15orf56Q8N910 161 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGKCP01834 107 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 AKR1D1P51857 326 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 HIGD2BQ4VC39 106 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SPINK8P0C7L1 97 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 EREGO14944 169 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 hDV102S1A0JD36 115 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C14orf177Q52M58 125 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SPAG11BQ08648 103 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 Q8N814 137 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TOMM7Q9P0U1 55 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LINC00526Q96FQ7 95 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TMEM223A0PJW6 202 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SCGB1D1O95968 90 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 ATOH7Q8N100 152 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PRSS2P07478 247 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 HERVK_113P61574 105 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 COX7B2Q8TF08 81 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 Q8IZM0 81 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KIAA0087Q14695 138 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C6orf226Q5I0X4 101 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 PYY3Q5JQD4 70 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 STPG4Q8N801 248 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CAMK2N2Q96S95 79 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C2orf48Q96LS8 159 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CKS1BP61024 79 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SLPIP03973 132 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 KRTAP10-2P60368 255 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 C2orf82Q6UX34 121 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 NDUFA1O15239 70 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SMIM6P0DI80 62 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 SYCNQ0VAF6 134 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CARD19Q96LW7 228 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 A0A1B0GVY2 172 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 LEPROTO15243 131 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 CXCL5P42830 114 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 Q6ZRU5 148 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 314.5 ms