RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
RNPS1-218ENST00000566180 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.53□□□□□ -0.24
RNPS1-218ENST00000566180 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
RNPS1-218ENST00000566180 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa13.52□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 MAJINQ3KP22 176 aa13.52□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 C2orf66Q6UXQ4 117 aa13.52□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 CYSLTR1Q9Y271 337 aa13.52□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 MYCBP2O75592 4640 aa13.51□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 A0A096LNI7 61 aa13.51□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA1644Q3SXP7 199 aa13.51□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM141Q96I45 108 aa13.51□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 C2orf48Q96LS8 159 aa13.51□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 Q6ZRU5 148 aa13.5□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.5□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 RHEBQ15382 184 aa13.49□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 OR10D4PQ8NGN7 298 aa13.49□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.49□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 LINC00474Q9P2X8 69 aa13.49□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 SPAG11BQ08648 103 aa13.48□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.48□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 STPG4Q8N801 248 aa13.48□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 NPSP0C0P6 89 aa13.47□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 COX19Q49B96 90 aa13.47□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 LINC00242Q5T6M2 205 aa13.47□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.47□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 IGIPA6NJ69 53 aa13.46□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 ORAOV1Q8WV07 137 aa13.46□□□□□ -0.25
RNPS1-218ENST00000566180 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa13.45□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.45□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 G0S2P27469 103 aa13.45□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 UBE2D1P51668 147 aa13.45□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 Q6ZN92 141 aa13.45□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 AMELXQ99217 191 aa13.45□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 A0A087WZ39 114 aa13.44□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 F8WDY8 70 aa13.44□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 J3QL48 77 aa13.44□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.44□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.44□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 VCX2Q9H322 139 aa13.44□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 MT-ND6P03923 174 aa13.43□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 PTTG1IPP53801 180 aa13.43□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 RNF151Q2KHN1 245 aa13.43□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.43□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 C7orf33Q8WU49 177 aa13.43□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 TOMM6Q96B49 74 aa13.42□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 GAGE2BQ13066 116 aa13.41□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 TIMM17AQ99595 171 aa13.41□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 FABP9Q0Z7S8 132 aa13.4□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa13.4□□□□□ -0.26
RNPS1-218ENST00000566180 LINC01546A6NGU7 62 aa13.39□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 APOC3P02656 99 aa13.39□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA0087Q14695 138 aa13.39□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa13.39□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 LINC01561Q8N1V8 128 aa13.39□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 HERC1Q15751 4861 aa13.39□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 A0A0J9YXV3 536 aa13.38□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 NDUFA1O15239 70 aa13.38□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 OXTP01178 125 aa13.38□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 ERASQ7Z444 233 aa13.38□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 C10orf25Q5T742 122 aa13.37□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 SNAPINO95295 136 aa13.36□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 NDUFA5Q16718 116 aa13.36□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.36□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 SVBPQ8N300 66 aa13.36□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.36□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 LINC01549A6NIU2 74 aa13.35□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1W2PNN7 141 aa13.34□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 SEC11AP67812 179 aa13.34□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.34□□□□□ -0.27
RNPS1-218ENST00000566180 FA2HQ7L5A8 372 aa13.33□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.32□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 HERVK_113P63121 156 aa13.32□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa13.32□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 SMCO4Q9NRQ5 59 aa13.31□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 C2orf82Q6UX34 121 aa13.3□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 Q6ZRP5 223 aa13.3□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa13.3□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.29□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa13.27□□□□□ -0.28
RNPS1-218ENST00000566180 PRSS2P07478 247 aa13.27□□□□□ -0.29
RNPS1-218ENST00000566180 Q8IZM0 81 aa13.27□□□□□ -0.29
RNPS1-218ENST00000566180 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.27□□□□□ -0.29
RNPS1-218ENST00000566180 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
RNPS1-218ENST00000566180 CST9LQ9H4G1 147 aa13.27□□□□□ -0.29
RNPS1-218ENST00000566180 TOMM7Q9P0U1 55 aa13.27□□□□□ -0.29
RNPS1-218ENST00000566180 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.26□□□□□ -0.29
RNPS1-218ENST00000566180 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms