RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf38	Q86SI9	138 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZRU5	148 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB5A	P20339	215 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf33	Q8WU49	177 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf48	Q96LS8	159 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM218	A2RU14	115 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	APOC3	P02656	99 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCYAP1	P18509	176 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAPIN	O95295	136 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	APOM	O95445	188 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC11C	Q9BY50	192 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PTTG1IP	P53801	180 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	IFITM10	A6NMD0	228 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N8P6	123 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	IMMP2L	Q96T52	175 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TNXB	P22105	4242 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SPAG11B	Q08648	103 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	SCO1	O75880	301 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MT1HL1	P0DM35	61 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	GAGE2B	Q13066	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF151	Q2KHN1	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM141	Q96I45	108 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WZ39	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0J9YXV3	536 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PNN7	141 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200		F8WDY8	70 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200		K7EMI3	77 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2D1	P51668	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0087	Q14695	138 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf25	Q5T742	122 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	AMELX	Q99217	191 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	IGIP	A6NJ69	53 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFA1	O15239	70 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NPS	P0C0P6	89 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZRP5	223 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	VCX2	Q9H322	139 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZN92	141 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	RHEB	Q15382	184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TOMM6	Q96B49	74 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	G0S2	P27469	103 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01600	Q96MT4	127 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMM17A	Q99595	171 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	S100P	P25815	95 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf82	Q6UX34	121 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC01546	A6NGU7	62 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM168B	A1KXE4	195 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB5B	P61020	215 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ERAS	Q7Z444	233 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PPP4C-205	ENST00000563200	HERVK_113	P63121	156 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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