RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	TOMM6	Q96B49	74 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	RTL8C	O15255	209 aa		5	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	CCL25	O15444	150 aa		5	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		5	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	TIMM17A	Q99595	171 aa		5	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312		Q9HAA7	133 aa		5	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH2	Q9P225	4427 aa		5	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	PSCA	O43653	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZN92	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZUT4	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HSBP1	O75506	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HBD	P02042	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312		A0A096LNJ9	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	SS18	Q15532	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	VCX2	Q9H322	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	SERF1A	O75920	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	ATP5L	O75964	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	AMELX	Q99217	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	SEC11A	P67812	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312		A0A087WTM6	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	XCL1	P47992	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2D1	P51668	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	NUPR1	O60356	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	PMVK	Q15126	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	COX7A2L	O14548	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFA6	P56556	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	HERVK_113	P63121	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	APOM	O95445	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	PRSS1	P07477	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312		Q8N814	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312		A0A087WZ39	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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