RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 A0A087X002 238 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 CTAG1AP78358 180 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 PPP1R2P9O14990 202 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 TCAPO15273 167 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 RAB4AP20338 218 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 CT83Q5H943 113 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 OCC1Q8TAD7 63 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 A0A1B0GUT8 65 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 K7EN84 100 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 HMSDA8MTL9 139 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 HBBP68871 147 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 IFITM10A6NMD0 228 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 BCE1O60756 84 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 AMN1Q8IY45 258 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 C22orf24Q9Y442 160 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 KIAA0087Q14695 138 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 HIGD1CA8MV81 97 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 SMLR1H3BR10 107 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 NRACQ8N912 160 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 ZNF727A8MUV8 499 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 SMKR1H3BMG3 65 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 RIGQ13278 110 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 C20orf78Q9BR46 151 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-228ENST00000551473 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 C2orf82Q6UX34 121 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 LINC00862A6NCI5 91 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 TMEM250H0YL14 139 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 PRSS2P07478 247 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 CKS1BP61024 79 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 UBE2AP49459 152 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 FAM104AQ969W3 186 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 Q6ZN92 141 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 CKS2P33552 79 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 Q8IZM0 81 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 OSTCQ9NRP0 149 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-228ENST00000551473 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 LINC00167Q96N53 147 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 TNFRSF6BO95407 300 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 RAB5AP20339 215 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 TMEM141Q96I45 108 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 A0A1B0GW15 77 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 F8VRH5 84 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 CEBPGP53567 150 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 RGS21Q2M5E4 152 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 LINC01551Q86U37 167 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 CXCL5P42830 114 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 S100A8P05109 93 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-228ENST00000551473 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.79□□□□□ -1.32
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