RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.77□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.76□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.76□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.75□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 FCER1GP30273 86 aa5.75□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 Q6ZUT4 128 aa5.75□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 BIN3Q9NQY0 253 aa5.75□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.74□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 A0A1B0GVG6 124 aa5.74□□□□□ -1.49
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KDM5A-211ENST00000544777 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.74□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.74□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 SMIM12Q96EX1 92 aa5.74□□□□□ -1.49
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KDM5A-211ENST00000544777 UBE2AP49459 152 aa5.73□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 KIAA0087Q14695 138 aa5.73□□□□□ -1.49
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KDM5A-211ENST00000544777 TMEM18Q96B42 140 aa5.73□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 NUDT11Q96G61 164 aa5.73□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF727A8MUV8 499 aa5.72□□□□□ -1.49
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KDM5A-211ENST00000544777 C2orf82Q6UX34 121 aa5.72□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.72□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.72□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.72□□□□□ -1.49
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KDM5A-211ENST00000544777 Q5BKY6 102 aa5.71□□□□□ -1.5
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KDM5A-211ENST00000544777 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.7□□□□□ -1.5
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KDM5A-211ENST00000544777 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.7□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 KIR2DL4Q99706 377 aa5.7□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.7□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.69□□□□□ -1.5
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KDM5A-211ENST00000544777 LINC00167Q96N53 147 aa5.69□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 MANBALQ9NQG1 85 aa5.69□□□□□ -1.5
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KDM5A-211ENST00000544777 IFITM3Q01628 133 aa5.68□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 GNG13Q9P2W3 67 aa5.68□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 UMAD1C9J7I0 102 aa5.67□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 HBBP68871 147 aa5.67□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.67□□□□□ -1.5
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KDM5A-211ENST00000544777 MED9Q9NWA0 146 aa5.66□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.66□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 PPP1R17O96001 155 aa5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 CKS1BP61024 79 aa5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 FAM104AQ969W3 186 aa5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 SSPOA2VEC9 5147 aa5.65□□□□□ -1.5
KDM5A-211ENST00000544777 SMKR1H3BMG3 65 aa5.64□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 PPP1R2P9O14990 202 aa5.64□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 PDE6DO43924 150 aa5.64□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 AMN1Q8IY45 258 aa5.64□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.64□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 A8MWL6 223 aa5.63□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 PRLHP81277 87 aa5.63□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.63□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.63□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 K7EN84 100 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 TCAPO15273 167 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 ARPC5O15511 151 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 NRACQ8N912 160 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 OCC1Q8TAD7 63 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 USH2AO75445 5202 aa5.62□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 A0A1B0GUT8 65 aa5.61□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 SPINK1P00995 79 aa5.61□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 Q6ZN92 141 aa5.61□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.61□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 Q8NBF4 154 aa5.61□□□□□ -1.51
KDM5A-211ENST00000544777 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
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