RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 APOMO95445 188 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFA5Q16718 116 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF151Q2KHN1 245 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZRP5 223 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.27□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 HBBP68871 147 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 C10orf25Q5T742 122 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 COMMD7Q86VX2 200 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM18Q96B42 140 aa7.26□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF213Q63HN8 5207 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PRSS47A8MTI9 375 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 KIAA0087Q14695 138 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 F8W036 122 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PPBPP02775 128 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 SPAG11BQ08648 103 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.24□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A8P05109 93 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.23□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 F8WDY8 70 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 UQCC3Q6UW78 93 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ORMDL3Q8N138 153 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.22□□□□□ -1.25
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A087WZ39 114 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM168BA1KXE4 195 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 REG3GQ6UW15 175 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 PRELID3AQ96N28 172 aa7.21□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 LPAP08519 4548 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IFITM10A6NMD0 228 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.2□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2D1P51668 147 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.19□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFA1O15239 70 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB5AP20339 215 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IMMP2LQ96T52 175 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 AMELXQ99217 191 aa7.18□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IGIPA6NJ69 53 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 C1orf137Q5JT78 98 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 C2orf82Q6UX34 121 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8N8P6 123 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM141Q96I45 108 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.17□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP6V1G1O75348 118 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MT-ND6P03923 174 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV7-43P04211 117 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM218A2RU14 115 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ADCYAP1P18509 176 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 GAGE2EQ4V326 116 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 MT-ND4LP03901 98 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 SEC11CQ9BY50 192 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 NPSP0C0P6 89 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 VCX2Q9H322 139 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 K7EMI3 77 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 H0Y9J4 135 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A1P23297 94 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 DIRC1Q969H9 104 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZN92 141 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.1□□□□□ -1.27
CLSTN3-211ENST00000541667 M0QXV9 152 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.4 ms